[发明专利]L1TD1作为结肠癌的预测生物标志物

说明书

本发明涉及生物标志物，例如含LINE‑1型转座酶结构域1(L1TD1)作为结肠癌的预后标志物。本发明还涉及预后结肠癌的方法，以及用于所述方法的试剂盒。

发明领域

本发明涉及分子诊断领域。更具体地，本发明涉及用于预后结肠癌的手段和方法。

发明背景

在多种癌症中已检测到干细胞样基因签名，并且胚胎干细胞因子OCT4和NANOG与多种癌症类型中增强的肿瘤发生和不良预后相关。

含LINE-1型转座酶结构域1(L1TD1)是未分化的胚胎干细胞自我更新所需的RNA结合蛋白。最近，显示L1TD1蛋白与人胚胎干细胞(hESC)中的OCT4、NANOG、LIN28和SOX2形成核心相互作用网络，而L1TD1的消耗导致hESC中OCT4、NANOG和LIN28的下调。早前的报道已经表明OCT4和NANOG与不同类型癌症的不良预后相关联。

除了胚胎干细胞，早前报道了在大脑和结肠以及在诸如精原细胞瘤、胚胎癌、髓母细胞瘤和结肠腺癌的不同癌症中有L1TD1的表达。已显示L1TD1对于胚胎癌细胞的自我更新至关重要，并支持精原细胞瘤细胞的生长。有趣的是，来自人类蛋白质图谱的免疫组织化学数据表明L1TD1在结肠癌样品的子集中以高水平表达。此外，WO 2013/033626和US 2010/0292094公开了相对于对照水平更高水平的L1TD1指示结肠癌、肿瘤性大肠细胞或倾向于肿瘤状态发作的细胞。

结肠癌是全球第三大最常诊断的癌症，2012年有140万新病例。尽管结直肠癌是研究最深入的癌症类型之一，但仍缺乏可预测的预后标志物。

发明概述

本发明的目的是提供用于预后受试者中的结肠癌的改进的方法和手段。

该目的通过以下方法、用途和试剂盒来实现，其特征在于独立权利要求中所述的内容。在从属权利要求中公开了本发明的一些具体实施方案。

因此，本发明提供了预后受试者中的结肠癌的方法，其中该方法包括对从所述受试者获得的样品测定L1TD1和ASRGL1表达的水平，和将测定的L1TD1和ASRGL1的水平与相应的对照水平进行比较，以及在所述比较的基础上预后所述结肠癌。还提供了L1TD1和ASRGL1在预后结肠癌中的用途。

在另一方面，本发明提供了用于本方法的试剂盒，该试剂盒包括一种或多种测试剂，所述测试剂能够特异性地检测从要确定其结肠癌的受试者获得的生物学样品中L1TD1和ASRGL1的表达水平。

在以下附图、详细描述和实例中阐述了本发明的其他方面、特定实施方案、目的、细节和优点。

附图的简要说明

在下文中，将参照附图通过优选实施方案更详细地描述本发明，其中

图1A至1C–Kaplan-Meier曲线显示了三个结肠癌数据集的无疾病生存。曲线展现了基于L1TD1表达水平(高或低)的两组结肠癌患者的生存数据。具有实线的曲线对应于具有高L1TD1表达的患者，具有点线的曲线代表具有低L1TD1表达的患者。x轴显示无疾病生存时间(以年为单位)，y轴显示无疾病生存的概率。风险表显示在给定时间点处于风险中的患者数量。