[发明专利]高通量多组学样品分析

权利要求书

1.一种样品分析方法，所述样品分析方法包括：

使来自细胞的双链脱氧核糖核酸(dsDNA)与转座体接触，其中所述转座体包含被配置为在包含dsDNA的结构处诱导双链DNA断裂的双链核酸酶和具有包含捕获序列的5’突出端的衔接子的两个拷贝，以产生多个突出dsDNA片段，每个突出dsDNA片段包含所述5’突出端的两个拷贝；

使用多个条形码对所述多个突出DNA片段进行条形码化以产生多个经条形码化的DNA片段，其中所述多个条形码中的每个包含细胞标记序列、分子标记序列和捕获序列，其中所述多个条形码中的至少两个包含不同的分子标记序列，并且其中所述多个条形码中的至少两个包含相同的细胞标记序列；

检测所述多个经条形码化的DNA片段的序列；并且

基于测序数据中的所述多个经条形码化的DNA片段的序列确定将dsDNA序列与包含dsDNA的结构相关的信息。

2.如权利要求1所述的方法，所述方法进一步包括：

使所述多个突出dsDNA片段与聚合酶接触以产生多个互补dsDNA片段，每个互补dsDNA片段包含与所述5’突出端的至少一部分互补的序列；并且

使所述多个互补dsDNA片段变性以产生多个单链DNA(ssDNA)片段，

其中对所述ssDNA片段进行条形码化，从而对所述DNA片段进行条形码化。

3.一种样品分析方法，所述样品分析方法包括：

从来自细胞的双链脱氧核糖核酸(dsDNA)产生多个核酸片段，其中所述多个核酸片段中的每个包含捕获序列、所述捕获序列的互补序列、所述捕获序列的反向互补序列或其组合；

使用多个条形码对所述多个核酸片段进行条形码化以产生多个经条形码化的DNA片段，其中所述多个条形码中的每个包含细胞标记序列、分子标记序列和捕获序列，其中所述多个条形码中的至少两个包含不同的分子标记序列，并且其中所述多个条形码中的至少两个包含相同的细胞标记序列；并且

检测所述多个经条形码化的DNA片段的序列。

4.如权利要求3所述的方法，所述方法进一步包括基于所述多个经条形码化的DNA片段的序列确定将dsDNA序列与包含dsDNA的结构相关的信息。

5.如权利要求3或4所述的方法，其中产生所述多个核酸片段包括：

使所述dsDNA与转座体接触，其中所述转座体包含被配置为在包含dsDNA的结构处诱导双链DNA断裂的双链核酸酶和包含所述捕获序列的衔接子的两个拷贝，以产生多个互补dsDNA片段，每个互补dsDNA片段包含与所述捕获序列互补的序列。

6.如权利要求3或4所述的方法，其中产生所述多个核酸片段包括：

使所述dsDNA与转座体接触，其中所述转座体包含被配置为在包含dsDNA的结构处诱导双链DNA断裂的双链核酸酶和具有包含捕获序列的5’突出端的衔接子的两个拷贝，以产生多个突出dsDNA片段，每个突出dsDNA片段包含所述5’突出端的两个拷贝；并且

使包含所述5’突出端的所述多个突出dsDNA片段与聚合酶接触以产生多个互补dsDNA片段，每个互补dsDNA片段包含与所述5’突出端的至少一部分互补的序列。

7.如权利要求3-6中任一项所述的方法，其中所述经条形码化的DNA片段是经条形码化的单链DNA。

8.如权利要求1或权利要求6所述的方法，其中所述多个互补dsDNA片段都不包含突出端。

9.如权利要求1、2或5-7中任一项所述的方法，其中所述衔接子包含转座子的DNA末端序列。

10.如权利要求1或5-8中任一项所述的方法，其中所述双链核酸酶包含转座酶，例如Tn5转座酶。

11.如权利要求3-10中任一项所述的方法，其中产生所述多个核酸片段包括使所述dsDNA片段化以产生多个dsDNA片段。