[发明专利]用于捕获DNA分子的DNA桥方法

权利要求书

1.一种在基底表面处理至少一个核酸分子的方法，其包括：

(a)在所述基底的所述表面拉伸核酸分子；和

(b)通过从所述基底的所述表面移除多个亚部分在所述基底的所述表面形成多个离散特征；

其中所述核酸分子与所述多个离散特征的两个成员接触，由此使所述核酸的一部分悬浮在所述多个离散特征的所述两个成员间。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个离散特征形成拓扑图案。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸分子与两个其他所述多个离散特征的两个其他成员接触。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述核酸分子的额外部分悬浮于所述多个离散特征的所述两个其他成员之间。

5.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括：

(c)在所述基底的所述表面形成水凝胶，所述水凝胶与所述多个离散特征的一些或全部成员接触。

6.根据权利要求5所述的方法，其中在(c)中所述核酸分子的至少一部分封闭在水凝胶中。

7.根据权利要求6所述的方法，其进一步包括：

(d)从所述基底的所述表面移除所述水凝胶。

8.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括，在(a)中，在所述基底的所述表面拉伸额外核酸分子。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述额外的核酸分子与所述多个离散特征的另两个成员接触，由此使所述额外的核酸分子悬浮于所述多个离散特征的所述另两个成员之间。

10.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其中所述多个离散特征的每一个独立地为坑、孔(pore)、槽、通道、孔(well)、柱、凸块、突起、脊或棒。

11.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其中所述多个离散特征的两个成员的每一个独立地为柱、凸块、突起、脊或棒。

12.根据权利要求3或4所述的方法，其中所述多个离散特征的两个其他成员的每一个独立地为柱、凸块、突起、脊或棒。

13.根据权利要求5-7任一项所述的方法，其中所述核酸分子的至少一部分封闭在所述水凝胶中。

14.根据权利要求8或9所述的方法，其中所述多个离散特征的两个其他成员每一个独立地为柱、凸块、突起、脊或棒。

15.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其中所述核酸分子是脱氧核糖核酸(DNA)。

16.根据权利要求15所述的方法，其中所述DNA是双链的或单链的。

17.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其中所述核酸分子在酶反应中是有活性的。

18.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其进一步包括：对所述核酸分子实施酶反应。

19.根据权利要求8或9所述的方法，其进一步包括：对所述额外核酸分子实施酶反应。

20.根据权利要求1-9任一项所述的方法，其进一步包括：对所述核酸分子实施蛋白结合反应、杂交反应、由聚合酶催化的引物延伸反应、切口翻译反应或切口延伸反应。

21.如权利要求8或9所述的方法，其进一步包括对所述额外的核酸分子实施蛋白结合反应、杂交反应、由聚合酶催化的引物延伸反应、切口翻译反应或切口延伸反应。