[发明专利]用于在重组酶介导的核酸序列向工程化的接受细胞发生盒交换整合期间追踪和操纵细胞的细胞表面标签交换(CSTE)系统

权利要求书

1.一种组合型系统，包含两个独立组件，其中第一组件是编码旁侧有3’内含子片段的第一细胞表面标签(CST)外显子和处于反义方向的目的基因(GOI)的标签-交换供体载体(TEDV)，并且第二组件是工程化细胞，所述的工程化细胞在其基因组内部含有标签-交换接受位点(TERS)，其编码与第一CST不同的、由完整内含子序列毗连至编码跨膜结构域的外显子的第二CST外显子，并且还编码处于反义方向的报告基因，其中配对的重组酶介导盒交换(RMCE)元件如此纳入TEDV和TERS中，从而RMCE在TEDV和TERS之间的执行导致报告元件交换成TEDV编码的GOI，以及第一CST外显子交换成第二CST外显子，从而衍生性工程化细胞现在表达第一CST和GOI，替代第二CST和报告基因。

2.根据根据权利要求1所述的组合型系统，其中第一组件是TEDV，其包含

a.第一RMCE元件

b.3’内含子片段

c.CST外显子

d.第一转录终止子

e.第二转录终止子

f.GOI

g.Kozak序列

h.第二RMCE元件

其中CST外显子和第一转录终止子以从GOI和相关的转录终止子和Kozak序列的反义方向编码。

3.根据权利要求1或2所述的组合型系统，其中第二组件是TERS，其包含

a.转录启动子元件

b.Kozak序列

c.跨膜结构域外显子

d.内含子

e.内含子序列内部编码的第一RMCE元件

f.CST外显子

g.第一转录终止子

h.第二转录终止子

i.报告基因

j.Kozak序列

k.第二RMCE元件

l.第二转录启动子元件

其中跨膜结构域外显子和CST外显子以从报告基因的反义方向如此编码，从而第一转录启动子元件驱动合并的跨膜结构域和CST转录，并且第二转录启动子元件驱动报告基因转录。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的组合型系统，其中TEDV的第一RMCE元件与TERS的第一RMCE元件配对，并且TEDV的第二RMCE元件与TERS的第二RMCE元件配对。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的组合型系统，其中每个CST外显子包含了编码一个或多个分子亲和标签的序列并且由TEDV和TERS编码的CST是不同的。

6.根据权利要求1至4中任一项所述的组合型系统，其中工程化细胞在其基因组中含有单个TERS。

7.从TERS基因座生成表达TEDV所编码GOI的衍生性工程化细胞的方法，所述方法包括，

a.生成编码GOI的TEDV

b.向含有配对TERS的工程化细胞系递送所述TEDV，连同匹配其中所编码RMCE元件的重组酶

c.使细胞与对TEDV编码的CST和TERS编码的CST都特异的两种或更多种亲和试剂接触

d.基于报告基因和TERS所编码CST的表达削弱和TEDV编码的CST表达增加，选择衍生性工程化细胞，作为选择整合有GOI的细胞的代理。

8.根据权利要求7所述的方法，其中用于步骤c.的亲和试剂是荧光标记的，从而检测削弱的TERS编码的CST表达和增加的TEDV编码的CST表达，从而使得基于所述表达，通过荧光激活细胞分选法划分和选择细胞成为可能。

9.根据权利要求7所述的方法，其中用于步骤c.的亲和试剂如此固定至基材上，从而在靶细胞群体中使用基材亲和法，如磁力激活细胞分选法，可以耗尽表达TERS所编码CST的细胞或可以富集表达TEDV所编码CST的细胞。