[发明专利]用于核酸检测的质量对照组合物和全生物体对照材料

说明书

本公开总体涉及用于评价核酸检测(NAT)的功能的质量对照组合物和全生物体对照材料，以及相关的方法、用途和试剂盒。在一些方面中，该NAT用于感测在检测物品中存在某种生物体和目标核酸序列，该质量对照组合物包括：(i)含第一核酸序列的第一受保护的核酸序列，该第一核酸序列的存在表征在检测物品中存在该生物体，所述第一核酸序列在NAT中被检测；以及(ii)含第二核酸序列的第二受保护的核酸序列，该第二核酸序列的存在表征在检测物品中存在目标核酸序列，所述第二核酸序列在NAT中被检测。

交叉引用

本申请要求于2018年5月18日提交的名称为“用于核酸检测的全生物体对照材料”的美国临时申请US 62/673,480的优先权，该临时申请的全部内容通过引用结合在此。相关的PCT受理局于2019年5月18日至20日(含)不办公。

技术领域

本公开总体涉及用于核酸检测(NAT)的全生物体对照材料、用于评价NAT的功能的质量对照组合物、以及用于感测被检样品(例如生物检测样品)中的感兴趣的生物体或核酸序列的方法。

背景技术

核酸检测和质量控制

生物有机体或性状存在的分析和/或诊断检测可利用感测生物体的核酸或核酸序列的方法来进行，该方法在广义上被称为核酸检测(NAT)。核酸检测的一个子集被称为核酸扩增检测(NAAT)，因为这些检测通常涉及有助于感测的核酸扩增。例如，这种方法可基于对生物体的特征DNA或RNA序列或特定性状或特征的感测。NAT可用于识别表征存在或不存在生物体(例如细菌、病毒或病原体或其他物种)的遗传状况或者性状或特征的特定核酸序列的存在。这种例子包括感测诸如体液、血液、尿液或组织等生物样品中的抗生素抗性细菌或疟疾或呼吸道病毒(例如流感病毒)。在其他方面，NAT可用于感测抗生素抗性(例如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的甲氧西林抗性)、疾病(例如疟疾或高毒流感)以及污染物或害虫(例如水中的大肠杆菌水平或土壤中的真菌孢子(例如枯草芽孢杆菌或霉菌的孔隙悬浮液))的存在。

NAT中的质量控制越来越重要，因为感测技术变得更加灵敏，结果不仅受生物变化性(例如样本或样本类型)的影响，而且受技术变化性的影响，例如样品处理过程中引入的任何差异、关键试剂的变化、检测环境中的污染控制、程序一致性、以及检测设备的正常运行。处理步骤越多，产生假阳性或假阴性的风险就越高。错误的结果可能产生非常有害的后果，这不仅体现在进行检测(或重新检测)的成本方面，而且体现在对健康和安全的危害方面——无论是对于被检测的患者还是对于环境或其他系统。鉴于许多NAT的多步骤特点，需要为整个过程使用可用作对照物的质量对照材料。

此外，还需要开发针对病原性和/或致命性和/或毒性生物体的可安全地生产、运输和处理的非病原性和/或非致命性和/或非毒性质量对照物。

对照物

已知其中存在或不存在分析物的样品、用于设计或开发检测、确定检测的正常运行(例如质疑、确认或评价与检测相关的操作、性能、设备、系统或程序，提供法规、法律或最佳实践原则所要求的证明检测的正常运行和/或结果的有效性的证据)的样品统称为“对照物”。