[发明专利]化合物结构的生成方法、化合物结构的生成程序及化合物结构的生成装置

说明书

本发明提供一种能够获取具有合成适用性的改变的化合物结构的化合物结构的生成方法、化合物结构的生成程序及化合物结构的生成装置。化合物结构的生成方法具备：工序(A)，准备评价合成适用性的基准的化合物数据库及化合物结构；工序(B)，选择对化合物结构追加原子或原子团或者从化合物结构中删除原子或原子团中的任一个；工序(C)，当选择了对化合物结构追加原子或原子团时，使新型原子或新型原子团键合于选自化合物结构中所包含的原子中的原子上，或者，当选择了从化合物结构中删除原子或原子团时，删除选自化合物结构中所包含的原子或原子团中的原子或原子团而得到改变的化合物结构；工序(D)，根据化合物数据库的信息来判断改变的化合物结构的合成适用性；工序(E)，当改变的化合物结构具有合成适用性时，概率上允许改变，当改变的化合物结构不具有合成适用性时，概率上拒绝改变；及工序(F)，重复进行工序(B)～(E)，直至经过了工序(E)的化合物结构满足结束条件。

技术领域

本发明涉及一种化合物结构的生成方法、化合物结构的生成程序及化合物结构的生成装置，尤其涉及一种具有合成适用性的化合物结构的生成技术。

背景技术

以往，具有所期望的物理特性值的化合物的结构的搜索主要是通过解决“正问题”(给出作为问题的原因的分子结构，求出作为结果的物理特性值)来进行的。随着近年来信息学的发展，关于“逆问题”(给出物理特性值，求出具有该物理特性值的分子结构)的解法的研究正在迅速发展中。关于基于解决逆问题的结构的搜索，例如已知有非专利文献1。在非专利文献1中记载有如下：给出物理特性值的目标，(1)生成多个初始结构(化学结构)，(2)使各结构随机地发生变化，(3)估计各结构的物理特性值，(4)以物理特性值与目标值的距离为基准采用或拒绝结构的变化，来求出具有接近目标的物理特性值的结构(在该过程中，重复进行(2)至(4)的处理)。如此，为了解决逆问题，需要进行(1)至(4)的技术。

在进行上述(1)至(4)时，需要一种能够评价化合物的合成适用性的技术。即，如果在计算机上生成和/或改变的化学结构都难以合成，则没有意义。需要一种能够生成具有合成适用性的化合物结构的技术，作为这种技术，已知有一种通过部分结构或片段(fragment)的学习进行结构生成的技术(参考非专利文献1、2)。另外，需要一种根据物理特性值的评价结果更新结构的技术(参考非专利文献1)。

以往技术文献

非专利文献

非专利文献1：“Bayesian molecular design with a chemical language”、Hisaki Ikebata等、[2018年7月23日搜索]、互联网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28281211)

非专利文献2：“RecGen(Refined Compound Generator)”、Kyoto ConstellaTechnologies Co.,Ltd.、[2018年7月23日检索]、互联网(http://recgen.czeek.jp/recgen/)

发明内容

发明要解决的技术课题

在非专利文献2中，在连接片段时，通过准备边缘部分并进行键合来抑制生成无法合成的结构。然而，在非专利文献2中，没有评价合成适用性。并且，非专利文献2的方法是一种对现有的结构逐渐添加新的结构的方法，难以从现有的结构中删除原子或原子团。

为了解决上述逆问题，需要在计算机上生成庞大数量的化合物结构。另一方面，当难以合成在计算机上生成的化合物结构时，会产生实际上无法合成解决逆问题而得到的结构的问题。

本发明是鉴于这种情况而完成的，其目的在于提供一种能够通过一边判断合成适用性一边删除原子或原子团来生成化合物结构的化合物结构的生成方法、化合物结构的生成程序及化合物结构的生成装置。

用于解决技术课题的手段