[发明专利]化合物的合成适用性的评价方法、化合物的合成适用性的评价程序及化合物的合成适用性的评价装置

说明书

本发明提供一种评价在计算机上生成和/或改变的化合物的合成适用性的化合物的合成适用性的评价方法、化合物的合成适用性的评价程序及化合物的合成适用性的评价装置。一种化合物的合成适用性的评价方法及执行程序、装置，所述化合物的合成适用性的评价方法具有如下工序：选择容纳有多个基准化合物的化合物数据库的工序；决定作为评价对象的化合物的结构的工序；从容纳于化合物数据库中的基准化合物的结构中提取基准原子排列并求出基准原子排列的基准出现频度的工序；从化合物的结构中提取原子排列并求出原子排列的出现频度的工序；及根据化合物的原子排列中所包含的键条数及与原子排列相对应的基准原子排列的出现频度来评价合成适用性的工序。

技术领域

本发明涉及一种化合物的合成适用性的评价方法、化合物的合成适用性的评价程序及化合物的合成适用性的评价装置，尤其涉及一种在计算机上生成或改变的化合物的合成适用性的评价方法、化合物的合成适用性的评价程序及化合物的合成适用性的评价装置。

背景技术

以往，具有所期望的物理特性值的化合物的结构的搜索主要是通过给出分子结构，求出作为结果的物理特性值来进行的，但是随着近年来信息学的发展，给出物理特性值，求出具有该物理特性值的分子结构的研究正在迅速发展中。关于根据物理特性值搜索分子结构的方法，例如已知有非专利文献1。在非专利文献1中记载有如下：给出物理特性值的目标，(1)生成多个初始结构(化学结构)，(2)使各结构随机地发生变化，(3)估计各结构的物理特性值，(4)以物理特性值与目标值的距离为基准采用或拒绝结构的变化，来求出具有接近目标的物理特性值的结构。在该过程中，重复进行(2)至(4)的处理。如此，为了根据物理特性值搜索分子结构，需要一种进行(1)至(4)的技术。

在进行上述(1)至(4)时，如果在(4)中求出的化学结构都难以合成，则没有意义，因此要求一种能够评价化合物的合成适用性的技术。作为这种评价方法，已知有计算SAscore(SyntheticAccessibilityscore：合成难度得分)的技术(参考非专利文献2)。SAscore取1至10的实数值，并且值越小，视为越容易合成。

以往技术文献

非专利文献

非专利文献1：“Bayesianmoleculardesignwithachemicallanguage”、HisakiIkebata等、[2018年7月23日搜索]、互联网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28281211)

非专利文献2：“EstimationofsyntheticAccessibilityscoreofdrug-likemoleculesbasedonmolecularcomplexityandfragmentcontributions”、PeterErtlandAnsgarSchuffenhauer,JournalofCheminfomatics2009,1；8[2018年7月23日搜索]、互联网(https://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/1758-2946-1-8)

发明内容

发明要解决的技术课题

在非专利文献2中所记载的SAscore通过如下处理而作为得分：提取化合物中的原子排列，以基于ECFC_4#片段的定义进行片段化，将数据库中的各片段的出现频度的对数作为该片段的贡献度而计算各片段的贡献度之和。然而，在非专利文献2中，考虑比较大的的片段或具有复杂的支链结构的片段，因此所提取的片段的一半成为在数据库中仅出现一次的片段。在数据库仅出现一次，表示是特定的分子固有的片段，该结果暗示着，若基于ECFC_4#片段，则容易产生这种分子固有的片段。

所提取的片段越大，或者越是具有复杂的支链结构，则在数据库中的出现频度变得越少。换言之，片段中所包含的键的条数越多，则在数据库中的出现频度变得越少。然而，有时即使是这种分子排列也不一定难以合成，有时无法适当地评价得分和合成适用性。