[发明专利]获取荧光原位杂交图像时的相机曝光控制在审
申请号: | 201980064501.7 | 申请日: | 2019-10-23 |
公开(公告)号: | CN112805553A | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | K·拉特克利夫 | 申请(专利权)人: | 徕卡生物系统成像股份有限公司 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G02B21/00;G01N21/27;G06K9/00;G02B21/16;G06K9/20;G06K9/32;G06K9/44;G06T5/30;G06T7/11;G06T7/155;G06T7/194;G06T5/00 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 酆迅;郑振 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 获取 荧光 原位杂交 图像 相机 曝光 控制 | ||
1.一种控制图像获取装置的方法,所述图像获取装置包括荧光显微镜装置,用以获取样品的荧光原位杂交FISH探针图像,所述样品使用FISH探针进行标记,所述方法包括:
将用于获取FISH探针图像的曝光设置为初始值;
使用所述曝光的所设置的所述值来获取FISH探针图像;
通过应用至少一个形态学运算符以标识图像强度提高的位置周围的感兴趣区域并且然后生成用于滤除除所述感兴趣区域以外的所有区域的FISH探针图像掩模,来对所述FISH探针图像进行图像处理;
将所述掩模应用于所述FISH探针图像,以确定所述感兴趣区域中的图像强度;以及
如果所述图像强度具有期望强度值,所述期望强度值指示所述FISH探针图像的正确曝光,则生成并且保存FISH记录,所述FISH记录包括正确曝光的FISH探针图像,否则,调整所述曝光值并且使用所述曝光的调整值迭代所述方法。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述初始曝光值被设置以获取曝光不足的FISH探针图像,并且其中调整所述曝光值包括增加其值,以使在所述方法迭代时,所述曝光值从所述初始值相继增加。
3.根据权利要求2所述的方法,其中一旦达到最大曝光值而没有获得具有所述期望强度值的图像强度的FISH探针图像,则终止所述曝光的所述相继增加,在这种情况下,所述FISH记录被生成并且与所获取的所述FISH探针图像中的一个FISH探针图像以及元数据一起被保存,所述元数据指示所述FISH探针图像的FISH信号不足。
4.根据权利要求1所述的方法,其中确定所述曝光的所述调整值包括:将第一因子与第二因子相乘,所述第一因子基于所述FISH探针图像的所述曝光与所述图像强度之间的比例,所述第二因子基于所述期望图像强度。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法被迭代至少一次以获取多个FISH探针图像,并且其中确定所述曝光的所述调整值包括:将第一因子与第二因子相乘,所述第一因子基于所获得的所述多个FISH探针图像中的每个FISH探针图像的所述曝光与所述图像强度的比例之和,所述第二因子基于所述期望图像强度。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法被迭代至少一次以获取多个FISH探针图像,并且其中通过将第一因子乘以第二因子来确定所述曝光的所述调整值,所述第一因子基于后续FISH探针图像中的一个FISH探针图像的所述曝光与所述图像强度之间的比例,所述第二因子基于所述期望图像强度。
7.权利要求1所述的方法,其中所述样品额外地使用复染剂进行标记,所述方法还包括:
获取所述样品的复染剂图像;
对所述复染剂图像进行图像处理以生成复染剂图像掩模,所述复染剂图像掩模滤除除复染区域或其周围的区域以外的所有区域;以及
将对所述FISH探针图像的所述图像处理局限于未被所述复染剂图像掩模滤除的所述区域。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述FISH记录还包括所述复染剂图像。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其中所述复染剂被配置为对细胞核进行染色。
10.一种计算机程序产品,用于控制图像获取装置以获取样品的荧光原位杂交FISH探针图像,所述样品使用FISH探针进行标记,所述计算机程序产品携载用于执行根据权利要求1至9中任一项所述的方法的机器可读指令。
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