[发明专利]酶促DNA修复在审
申请号: | 201980065739.1 | 申请日: | 2019-09-18 |
公开(公告)号: | CN112823390A | 公开(公告)日: | 2021-05-18 |
发明(设计)人: | R·N·格拉斯;A·X·C·科尔;W·陈 | 申请(专利权)人: | 微软技术许可有限责任公司 |
主分类号: | G11C13/00 | 分类号: | G11C13/00;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 姚杰 |
地址: | 美国华*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 修复 | ||
1.一种在脱氧核糖核酸DNA中存储数字信息的方法,包括:
将所述数字信息编码为核苷酸的序列;
合成具有所述核苷酸的序列的合成DNA分子;
存储所述合成DNA分子;
将所述合成DNA分子与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;
在与所述修复混合物的所述接触之后,对所述合成DNA分子进行测序以生成序列数据;以及
对所述序列数据进行解码以获得再生的数字信息。
2.根据权利要求1所述的方法,其中对所述数字信息进行编码使用包括错误校正的编码方案。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,继合成所述合成DNA分子之后,所述合成DNA分子被维持在不大于约25℃的温度,直到将所述合成DNA分子与所述修复混合物接触。
4.一种修复对数字信息进行编码的合成DNA的方法,包括:
将所述合成DNA与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;以及
通过聚合酶链反应PCR来扩增所述合成DNA,其中与未与所述修复混合物接触的所述合成DNA的PCR扩增相比,在与所述修复混合物的所述接触之后的所述合成DNA的PCR扩增将Cq循环数降低至少1.5。
5.根据权利要求4所述的方法,其中与未与所述修复混合物接触的所述合成DNA的PCR扩增相比,在与所述修复混合物的所述接触之后的所述合成DNA的PCR扩增将所述Cq循环数降低至少2.0。
6.一种恢复被存储在合成DNA中的数字信息的方法,包括:
确定所述合成DNA中的完整DNA链的数量小于阈值水平;
将所述合成DNA与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;以及
对所述合成DNA进行测序以生成序列数据。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述阈值水平基于针对存储之前的所述合成DNA的Cq值和针对存储之后的所述合成DNA的Cq值之差。
8.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中将所述合成DNA与所述修复混合物接触在约37℃被执行约4小时。
9.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述合成DNA具有约100-180个bp的长度,并且根据所述数字信息的预定编码由寡核苷酸合成器来合成。
10.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Bst DNA聚合酶、Taq DNA连接酶、核酸内切酶IV、T4核酸内切酶V和核酸内切酶VIII。
11.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括以下中的至少一项:T4核酸内切酶V、核酸内切酶IV或核酸内切酶VIII。
12.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Bst DNA聚合酶。
13.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Taq DNA连接酶。
14.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物基本上由T4核酸内切酶V组成。
15.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物基本上由核酸内切酶IV组成。
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