[发明专利]酶促DNA修复在审

专利信息
申请号: 201980065739.1 申请日: 2019-09-18
公开(公告)号: CN112823390A 公开(公告)日: 2021-05-18
发明(设计)人: R·N·格拉斯;A·X·C·科尔;W·陈 申请(专利权)人: 微软技术许可有限责任公司
主分类号: G11C13/00 分类号: G11C13/00;C12Q1/6869
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 姚杰
地址: 美国华*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: dna 修复
【权利要求书】:

1.一种在脱氧核糖核酸DNA中存储数字信息的方法,包括:

将所述数字信息编码为核苷酸的序列;

合成具有所述核苷酸的序列的合成DNA分子;

存储所述合成DNA分子;

将所述合成DNA分子与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;

在与所述修复混合物的所述接触之后,对所述合成DNA分子进行测序以生成序列数据;以及

对所述序列数据进行解码以获得再生的数字信息。

2.根据权利要求1所述的方法,其中对所述数字信息进行编码使用包括错误校正的编码方案。

3.根据权利要求1所述的方法,其中,继合成所述合成DNA分子之后,所述合成DNA分子被维持在不大于约25℃的温度,直到将所述合成DNA分子与所述修复混合物接触。

4.一种修复对数字信息进行编码的合成DNA的方法,包括:

将所述合成DNA与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;以及

通过聚合酶链反应PCR来扩增所述合成DNA,其中与未与所述修复混合物接触的所述合成DNA的PCR扩增相比,在与所述修复混合物的所述接触之后的所述合成DNA的PCR扩增将Cq循环数降低至少1.5。

5.根据权利要求4所述的方法,其中与未与所述修复混合物接触的所述合成DNA的PCR扩增相比,在与所述修复混合物的所述接触之后的所述合成DNA的PCR扩增将所述Cq循环数降低至少2.0。

6.一种恢复被存储在合成DNA中的数字信息的方法,包括:

确定所述合成DNA中的完整DNA链的数量小于阈值水平;

将所述合成DNA与修复混合物接触,所述修复混合物包括以下中的至少一项:DNA聚合酶、DNA连接酶或核酸内切酶;以及

对所述合成DNA进行测序以生成序列数据。

7.根据权利要求6所述的方法,其中所述阈值水平基于针对存储之前的所述合成DNA的Cq值和针对存储之后的所述合成DNA的Cq值之差。

8.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中将所述合成DNA与所述修复混合物接触在约37℃被执行约4小时。

9.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述合成DNA具有约100-180个bp的长度,并且根据所述数字信息的预定编码由寡核苷酸合成器来合成。

10.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Bst DNA聚合酶、Taq DNA连接酶、核酸内切酶IV、T4核酸内切酶V和核酸内切酶VIII。

11.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括以下中的至少一项:T4核酸内切酶V、核酸内切酶IV或核酸内切酶VIII。

12.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Bst DNA聚合酶。

13.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物包括Taq DNA连接酶。

14.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物基本上由T4核酸内切酶V组成。

15.根据权利要求1-7中的任一项所述的方法,其中所述修复混合物基本上由核酸内切酶IV组成。

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