[发明专利]成孔肽的基于寡核苷酸的调节以增加孔尺寸、膜亲和性、稳定性和抗菌活性在审
申请号: | 201980066080.1 | 申请日: | 2019-10-04 |
公开(公告)号: | CN113166209A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 阿齐兹·芬诺瑞;乔纳森·李斯特;迈克尔·迈尔 | 申请(专利权)人: | 弗里堡大学阿道夫梅克尔研究所 |
主分类号: | C07K14/245 | 分类号: | C07K14/245 |
代理公司: | 江苏圣典律师事务所 32237 | 代理人: | 郭先彬 |
地址: | 瑞士弗里*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 成孔肽 基于 寡核苷酸 调节 增加 尺寸 亲和性 稳定性 抗菌 活性 | ||
1.一种杂交成孔化合物,包括:
具有第一末端和第二末端的成孔肽或蛋白质,其中第一寡核苷酸连接到所述第一末端,其中所述第一寡核苷酸来自DNA、RNA、LNA、BNA或PNA,其中第一功能基团连接到所述第二末端,并且其中所述第一功能基团是亲水的。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中第二功能基团连接至与所述第一寡核苷酸杂交的第二寡核苷酸,所述第一寡核苷酸结合至所述肽的所述第一末端,其中所述第二寡核苷酸来自DNA、RNA、LNA、BNA或PNA,其中所述第二功能基团是疏水膜结合剂、受体、药物分子、抗体、适配体、代谢物或荧光标记物。
3.根据权利要求2所述的化合物,其中存在所述疏水膜结合剂并包括胆固醇基团。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的化合物,其中结合至所述肽的所述第二末端的所述第一功能基团为第三寡核苷酸或荧光团,其中所述第三寡核苷酸来自DNA、RNA、LNA、BNA或PNA。
5.根据权利要求1-4中任一项的所述化合物,其中具有多个,优选4、6、8或12个互补杂交位点的模板链与连接至所述第一末端的所述第一寡核苷酸的一部分杂交。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的化合物,其中存在多个成孔肽或蛋白质,每个第一寡核苷酸连接至与所述模板链杂交的所述第一末端,从而使所述化合物形成较大的孔。
7.根据权利要求1-5中任一项所述的化合物,其中存在多个成孔肽或蛋白质,每个第一寡核苷酸连接至与所述模板链杂交的所述第一末端,从而使所述化合物具有四聚体、六聚体、八聚体或十二聚体孔构型。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的化合物,其中存在所述成孔肽,并且所述成孔肽是Ceratotoxin A(CtxA)。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的化合物,其中所述第一功能基团是所述第三寡核苷酸,并且其中第二膜结合剂连接至所述第三寡核苷酸以帮助稳定由所述化合物形成的孔。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的化合物,其中所述肽或蛋白质在所述第一末端与所述第二末端的功能化不同。
11.一种形成根据权利要求1至10中任一项所述的杂交成孔化合物的方法,包括以下步骤:
获得i)所述成孔肽或蛋白质,ii)所述第一寡核苷酸和iii)所述第一功能基团;以及
通过i)、ii)、iii)的自组装形成所述成孔化合物。
12.根据权利要求11所述的方法,还包括在溶液中使具有多个互补杂交位点的模板链与包含i)、ii)、iii)的过量的所述成孔化合物反应的步骤;去除过量的未反应的成孔化合物,优选是通过高压液相色谱法。
13.根据权利要求12所述的方法,还包括将所述第一寡核苷酸与所述第二寡核苷酸杂交的步骤,其中所述第二寡核苷酸与所述第一寡核苷酸相比以过量存在。
14.一种膜,包括基质和根据权利要求1-10中任一项所述的化合物,其中所述化合物在所述基质的第一侧和所述基质的第二侧之间提供孔。
15.根据权利要求1-4中任一项所述的化合物,其中延伸的、优选刚性的核酸纳米结构作为模板,用于将多个、优选20或40个孔形成物组装成孔,其中所述核酸纳米结构优选包含直接连接到其上的所述第二功能基团,并且其中所述核酸纳米结构优选是DNA折纸结构或单链拼接组装体或RNA折纸结构。
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