[发明专利]糖链结构解析装置和糖链结构解析用程序在审
申请号: | 201980066629.7 | 申请日: | 2019-05-23 |
公开(公告)号: | CN112805560A | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | 村瀬雅树;西风隆司 | 申请(专利权)人: | 株式会社岛津制作所 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62 |
代理公司: | 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 | 代理人: | 刘新宇;李茂家 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 链结 解析 装置 程序 | ||
1.一种糖链结构解析装置,其特征在于,其为基于对试样进行质谱分析而得到的质谱数据来解析连接有唾液酸的糖链的结构的糖链结构解析装置,所述试样用唾液酸连接方式特异性化学修饰试剂进行了前处理、并且包含连接有唾液酸的糖链或被该糖链修饰的分子,
所述糖链结构解析装置具备:
条件设定部,其用于供用户设定解析对象的离子种、该离子种的电荷的极性、和因修饰而产生糖链质量变化的质量变化因子;
糖链核心结构信息获取部,其获取具有由多种类的多个单糖残基构成的核心结构的各种糖链和与其对应的质量信息;
理论质量计算部,其基于所述条件设定部中设定的质量变化因子对所述糖链核心结构信息获取部所获取的各种糖链增加或减少质量,从而求出糖链理论质荷比;和
糖链结构推定部,其将所述糖链理论质荷比与所提供的质谱数据中的离子峰的质荷比进行对照,从而推定糖链结构,
所述条件设定部具有唾液酸连接方式特异性化学修饰对应质量变化设定部,所述唾液酸连接方式特异性化学修饰对应质量变化设定部供用户能够独立于其它修饰地设定作为质量变化因子之一的唾液酸连接方式特异性化学修饰,
所述理论质量计算部求出与所述唾液酸连接方式特异性化学修饰对应质量变化设定部中设定的化学修饰相对应地对每种唾液酸连接方式增加或减少质量而得到的糖链理论质荷比。
2.根据权利要求1所述的糖链结构解析装置,其特征在于,
所述糖链核心结构信息获取部在限制单糖残基的种类和其数量的条件下对假设的糖链结构进行穷举推定,求出具有核心结构的各种糖链和与其对应的质量信息。
3.根据权利要求1所述的糖链结构解析装置,其特征在于,
还具备存储有各种糖链结构和质量的糖链结构数据库,
所述糖链核心结构信息获取部基于用户所设定的糖链的质量信息对所述糖链结构数据库中存储的信息进行检索,由此求出具有核心结构的各种糖链。
4.根据权利要求1所述的糖链结构解析装置,其特征在于,
还具备显示处理部,所述显示处理部使由所述糖链结构推定部推定出的糖链结构的信息显示于显示部,
在推定出的糖链结构包含唾液酸且能够识别连接方式的情况下,该显示处理部对每个唾液酸还显示表示连接方式的信息。
5.根据权利要求1所述的糖链结构解析装置,其特征在于,
所述唾液酸连接方式特异性化学修饰对应质量变化设定部能够选择预定的唾液酸连接方式特异性化学修饰、并且能够对其以外的化学修饰输入每种唾液酸连接方式的质量变化值。
6.一种糖链结构解析用程序,其特征在于,其为用于基于对试样进行质谱分析而得到的质谱数据来解析连接有唾液酸的糖链的结构的糖链结构解析用程序,所述试样用唾液酸连接方式特异性化学修饰试剂进行了前处理、并且包含连接有唾液酸的糖链或被该糖链修饰的分子,所述糖链结构解析用程序使计算机作为如下的功能部而工作:
条件设定功能部,其供用户设定解析对象的离子种、该离子种的电荷的极性、和因修饰而产生糖链质量变化的质量变化因子;
糖链核心结构信息获取功能部,其获取具有由多种类的多个单糖残基构成的核心结构的各种糖链和与其对应的质量信息;
理论质量计算功能部,其基于通过所述条件设定功能部而设定的质量变化因子对由所述糖链核心结构信息获取功能部获取的各种糖链增加或减少质量,从而求出糖链理论质荷比;和
糖链结构推定功能部,其将所述糖链理论质荷比与所提供的质谱数据中的离子峰的质荷比进行对照,从而推定糖链结构,
所述条件设定功能部供用户独立于其它修饰地设定作为质量变化因子之一的唾液酸连接方式特异性化学修饰,
所述理论质量计算功能部求出与所设定的唾液酸连接方式特异性化学修饰相对应地对每种唾液酸连接方式增加或减少质量而得到的糖链理论质荷比。
7.根据权利要求6所述的糖链结构解析用程序,其特征在于,
所述糖链核心结构信息获取功能部在限制单糖残基的种类和其数量的条件下对假设的糖链结构进行穷举推定,求出具有核心结构的各种糖链和与其对应的质量信息。
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