[发明专利]使用糖类结合试剂和膜透过性试剂进行样品多重化

权利要求书

1.一种用于样品鉴定的方法，所述方法包括：

使多于一个样品中的每一个分别与多于一种样品索引组合物中的样品索引组合物接触，

其中所述多于一个样品中的每一个包含一个或更多个细胞，每一个细胞包含一种或更多种细胞表面糖类靶，其中所述样品索引组合物包含与样品索引寡核苷酸缔合的糖类结合试剂，其中所述糖类结合试剂能够与所述一种或更多种细胞表面糖类靶中的至少一种特异性结合，

其中所述样品索引寡核苷酸包含样品索引序列，并且其中所述多于一种样品索引组合物中的至少两种样品索引组合物的样品索引序列包含不同的序列；并且

基于所述多于一种样品索引组合物中的至少一个样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述一个或更多个细胞中的至少一个细胞的样品来源。

2.根据权利要求1所述的方法，其中鉴定所述至少一个细胞的样品来源还包括：

使用多于一个条形码将所述多于一种样品索引组合物中的样品索引寡核苷酸条形码化以产生多于一个条形码化样品索引寡核苷酸；

获得所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸的测序数据；并且

基于所述测序数据中所述多于一个条形码化样品索引寡核苷酸中的至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述细胞的样品来源。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中鉴定所述至少一个细胞的样品来源包括鉴定所述多于一种样品索引组合物中的至少一个样品索引寡核苷酸的样品索引序列的存在或不存在。

4.根据权利要求3所述的方法，其中鉴定所述样品索引序列的存在或不存在包括：

复制所述至少一个样品索引寡核苷酸以产生多于一个复制的样品索引寡核苷酸；

获得所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸的测序数据；并且

基于所述测序数据中对应于所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的所述多于一个样品索引寡核苷酸的复制的样品索引寡核苷酸的样品索引序列鉴定所述细胞的样品来源。

5.根据权利要求4所述的方法，

其中复制所述至少一个样品索引寡核苷酸以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸包括：在复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸之前，将复制衔接子连接至所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸，并且

其中复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸包括使用连接至所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸的复制衔接子复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸。

6.根据权利要求4所述的方法，

其中复制所述至少一个样品索引寡核苷酸以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸包括：在复制所述至少一个条形码化样品索引寡核苷酸之前，

使捕获探针与所述至少一个样品索引寡核苷酸接触以产生与所述样品索引寡核苷酸杂交的捕获探针；并且

将与所述样品索引寡核苷酸杂交的捕获探针延伸以产生与所述捕获探针缔合的样品索引寡核苷酸，并且

其中复制所述至少一个样品索引寡核苷酸包括复制与所述捕获探针缔合的样品索引寡核苷酸以产生所述多于一个复制的样品索引寡核苷酸。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述样品索引寡核苷酸与所述糖类结合试剂附接。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述样品索引寡核苷酸与所述糖类结合试剂共价地附接。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述样品索引寡核苷酸与所述糖类结合试剂缀合。

10.根据权利要求9所述的方法，其中所述样品索引寡核苷酸与所述糖类结合试剂通过选自由以下组成的组的化学基团缀合：可UV光裂解基团、链霉抗生物素蛋白、生物素、胺及其组合。

11.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述样品索引寡核苷酸与所述糖类结合试剂非共价地附接。