[发明专利]诱导具有突变基因的细胞的死亡的组合物以及通过使用所述组合物诱导具有突变基因的细胞的死亡的方法

权利要求书

1.一种包含核酸酶和切割剂的组合物，其用于诱导具有基因组序列变异的细胞的死亡，所述切割剂特异性识别包含具有基因组序列变异的细胞所特有的突变体序列的核酸序列。

2.一种包含核酸酶和切割剂的用于治疗癌症的组合物，所述切割剂特异性识别包含所述癌症所特有的插入和/或缺失的核酸序列。

3.根据权利要求1或2所述的组合物，其中所述核酸酶是限制酶、锌指核酸酶(ZNFN)、转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)或Cas蛋白。

4.根据权利要求3所述的组合物，其中所述Cas蛋白是Cas3、Cas9、Cpf1、Cas6、C2c12或C2c2。

5.根据权利要求3所述的组合物，其中所述Cas蛋白源自包含Cas蛋白的直系同源物的微生物属，其选自棒杆菌属(Corynebacter)、萨特氏菌属(Sutterella)、军团菌属(Legionella)、密螺旋体属(Treponema)、产线菌属(Filifactor)、真杆菌属(Eubacterium)、链球菌属(Streptococcus)(化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes))、乳杆菌属(Lactobacillus)、支原体属(Mycoplasma)、拟杆菌属(Bacteroides)、黄沃拉菌属(Flaviivola)、黄杆菌属(Flavobacterium)、固氮螺菌属(Azospirillum)、葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)、奈瑟氏菌属(Neisseria)、罗斯氏菌属(Roseburia)、细小棒菌属(Parvibaculum)、葡萄球菌属(Staphylococcus)(金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus))、硝酸盐裂解菌属(Nitratifractor)、棒状杆菌属(Corynebacterium)和弯曲杆菌属(Campylobacter)，并且其中所述Cas蛋白是从中分离的或重组的。

6.根据权利要求1或2所述的组合物，其中所述切割剂是包含选自SEQ ID NO:1至163所示序列的至少一个序列的指导RNA。

7.根据权利要求1所述的组合物，其中具有基因组序列变异的细胞是癌细胞。

8.根据权利要求1或2所述的组合物，其中所述特异性识别包含正常细胞所特有的插入和/或缺失的核酸序列的切割剂是包含选自SEQ ID NO:61至90所示序列的至少一个序列的指导RNA。

9.根据权利要求2所述的组合物，其中所述癌症是结直肠癌，并且所述特异性识别包含所述结直肠癌所特有的插入和/或缺失的核酸序列的切割剂是包含选自SEQ ID NO:1至30所示序列的至少一个序列的指导RNA。

10.根据权利要求2所述的组合物，其中所述癌症是骨肉瘤，并且所述特异性识别包含所述骨肉瘤所特有的插入和/或缺失的核酸序列的切割剂是包含选自SEQ ID NO:31至60所示序列的至少一个序列的指导RNA。

11.根据权利要求2所述的组合物，其中所述癌症是胶质母细胞瘤，并且所述特异性识别包含所述胶质母细胞瘤所特有的插入和/或缺失的核酸序列的切割剂是包含选自SEQ IDNO:121至136所示序列的至少一个序列的指导RNA。

12.根据权利要求2所述的组合物，其中所述癌症是肺癌，并且所述特异性识别包含所述肺癌所特有的插入和/或缺失的核酸序列的切割剂是包含选自SEQ ID NO:137至163所示序列的至少一个序列的指导RNA。

13.根据权利要求1或2所述的组合物，其中所述组合物通过在所述核酸序列的区域中诱导双链断裂(DSB)来诱导细胞死亡，所述核酸序列包含具有基因组序列变异的细胞所特有的插入和/或缺失。