[发明专利]邻近相互作用分析

权利要求书

1.一种用于评估样品中多肽与部分之间的同一性和空间关系的方法，所述方法包含：

a)在样品中的多肽的位点和所述样品中的部分的位点之间形成连接结构，所述连接结构包含与所述多肽的位点缔合的多肽标签以及与所述部分的位点缔合的部分标签，其中所述多肽标签和所述部分标签缔合；

b)在所述缔合的多肽标签和所述部分标签之间转移信息或连接所述缔合的多肽标签和所述部分标签以形成共享的唯一分子标识符(UMI)和/或条形码；

c)通过从所述部分解离所述多肽并从所述部分标签解离所述多肽标签，同时维持所述多肽与所述多肽标签之间的缔合并维持所述部分与所述部分标签之间的缔合来破坏所述连接结构；以及

d)评估所述多肽标签和所述多肽的至少部分序列，以及评估所述部分标签以及所述部分的至少部分同一性，

其中所述多肽标签和所述部分标签的所述评估部分包含所述共享的唯一分子标识符(UMI)和/或条形码，其指示所述样品中所述多肽的位点和所述部分的位点在空间上的邻近性。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述部分包含多肽。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述部分包含多核苷酸。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中，所述多肽标签包含多核苷酸。

5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中，所述部分标签包含多核苷酸。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，所述多肽标签包含第一多核苷酸，并且所述部分标签包含第二多核苷酸，所述第一和第二多核苷酸包含互补序列，并且所述多肽标签和所述部分标签经由所述互补序列缔合。

7.根据权利要求6所述的方法，其中，在所述缔合的多肽标签与部分标签之间转移信息包含延伸所述多肽标签的第一多核苷酸和所述部分标签的第二多核苷酸两者以形成所述共享的UMI和/或条形码。

8.根据权利要求6所述的方法，其中，在所述缔合的多肽标签与部分标签之间转移信息包含延伸所述多肽标签的第一多核苷酸和所述部分标签的第二多核苷酸之一以形成所述共享的UMI和/或条形码。

9.根据权利要求5所述的方法，其中，所述多肽标签包含双链多核苷酸，并且所述部分标签包含双链多核苷酸，并且在所述缔合的多肽标签与部分标签之间转移信息包含连接所述双链多核苷酸以形成所述共享的UMI和/或条形码。

10.根据权利要求9所述的方法，其中，所述共享的UMI和/或条形码包含所述双链多核苷酸的序列。

11.根据权利要求9所述的方法，其中，所述共享的UMI和/或条形码包含所述双链多核苷酸之一的序列。

12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中，在所述连接结构中，所述多肽标签和所述部分标签稳定缔合。

13.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中，在所述连接结构中，所述多肽标签和所述部分标签瞬时缔合。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中，在所述连接结构中，所述多肽标签和所述部分标签直接缔合。

15.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中，在所述连接结构中，所述多肽标签和所述部分标签例如经由所述多肽标签和所述部分标签之间的接头或UMI间接缔合。