[发明专利]孔

权利要求书

1.一种用于表征靶多核苷酸的系统，所述系统包括膜和孔复合物；

其中所述孔复合物包括：(i)定位在所述膜中的纳米孔；以及(ii)附接到所述纳米孔的辅助蛋白或肽；

其中所述纳米孔和所述辅助蛋白或肽一起形成跨所述膜的连续通道，所述通道包括第一收缩区域和第二收缩区域；

其中所述第一收缩区域由所述纳米孔的一部分形成，并且其中所述第二收缩区域由所述辅助蛋白或肽的至少一部分形成。

2.根据权利要求1所述的系统，其中所述辅助蛋白是多聚体蛋白。

3.根据权利要求1或2所述的系统，其中所述辅助蛋白不在膜中天然形成纳米孔和/或不包括在膜中天然形成的跨膜孔复合物的组分或其片段。

4.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽是环形的。

5.根据权利要求1到4中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白选自GroES、CsgF、正五聚蛋白、SP1以及其功能同源物和片段。

6.根据权利要求1或2所述的系统，其中所述辅助蛋白是跨膜蛋白纳米孔或其片段。

7.根据权利要求3或6所述的系统，其中所述跨膜蛋白孔选自MspA、α-溶血素、CsgG、胞溶素、InvG、GspD、杀白细胞素、FraC、气单胞菌溶素、NetB以及其功能同源物和片段。

8.根据权利要求1或2所述的系统，其中所述辅助蛋白包括跨膜蛋白孔复合物的组分的片段(其中当所述纳米孔是CsgG孔时，所述片段不是CsgF的片段)。

9.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽的至少一部分定位在所述纳米孔的腔内。

10.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述第二收缩部由所述辅助蛋白或肽的至少一部分形成，所述部分定位在所述纳米孔的腔内。

11.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽完全定位在所述纳米孔的腔内。

12.根据权利要求1到8中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽定位在所述纳米孔的腔外部。

13.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽通过一个或多个共价键附接到所述纳米孔。

14.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白或肽通过一种或多种非共价相互作用附接到所述纳米孔。

15.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述辅助蛋白是经修饰的辅助蛋白或肽，与对应的天然存在的辅助蛋白或肽相比，所述经修饰的辅助蛋白或肽包括至少一个氨基酸修饰。

16.根据权利要求15所述的系统，其中所述经修饰的辅助蛋白或肽包括：(i)所述跨膜蛋白纳米孔与所述辅助蛋白或肽之间的界面处的至少一个氨基酸残基，所述氨基酸残基不存在于对应的天然存在的辅助蛋白或肽中；和/或(ii)形成所述第二收缩部的部分的至少一个氨基酸残基，所述氨基酸残基不存在于对应的天然存在的辅助蛋白或肽中。

17.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述第一收缩部和/或所述第二收缩部的最小直径为约0.5nm到约2nm。

18.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述膜包括两亲分子层。

19.根据前述权利要求中任一项所述的系统，其中所述膜是固态层。