[发明专利]用于促进克隆选择的系统和方法

权利要求书

1.一种用于促进克隆选择的方法，该方法包括：

由第一成像单元生成包含培养基的孔的多个时间序列图像，该多个时间序列图像包括在第一时间生成的第一时间序列图像和在晚于该第一时间的第二时间生成的第二时间序列图像；

通过一个或多个处理器分析该第一时间序列图像来检测该第一时间序列图像中描绘的一个或多个候选对象；

针对该一个或多个候选对象中的每一个，通过该一个或多个处理器使用卷积神经网络分析该候选对象的图像来确定该候选对象是否为单个细胞；

通过该一个或多个处理器分析该第二时间序列图像来检测该第二时间序列图像中描绘的细胞集落；

由该一个或多个处理器至少部分地基于该一个或多个候选对象中的每一个是否被确定为单个细胞来确定该细胞集落是否仅由一个细胞形成；以及

由该一个或多个处理器生成指示该细胞集落是否仅由一个细胞形成的输出数据。

2.如权利要求1所述的方法，其中：

该方法包括使用该卷积神经网络确定该一个或多个候选对象中的第一候选对象是单个细胞；并且

确定该细胞集落是否仅由一个细胞形成进一步包括将该第一候选对象在该孔内的位置与该细胞集落在该孔内的位置进行比较。

3.如权利要求1或2所述的方法，其中：

该多个时间序列图像进一步包括在该第一时间与该第二时间之间的第三时间生成的第三时间序列图像；

该方法包括使用该卷积神经网络确定该一个或多个候选对象中的第一候选对象是单个细胞；并且

确定该细胞集落是否仅由一个细胞形成进一步包括通过至少分析该第三时间序列图像来确定该细胞集落是否是由该第一候选对象发展而成。

4.如权利要求3所述的方法，其中，确定该细胞集落是否是由该第一候选对象发展而成包括确定该第三时间序列图像是否描绘了这样的中间细胞集落，该中间细胞集落满足以下条件之一或全部：(i)细胞计数与该细胞集落相比更小，或(ii)大小与该细胞集落相比更小。

5.如权利要求3所述的方法，其中，确定该细胞集落是否是由该第一候选对象发展而成包括：(i)确定该第三时间序列图像描绘了该中间细胞集落，以及(ii)将该中间细胞集落在该孔内的位置与该细胞集落在该孔内的位置和/或该第一候选对象在该孔内的位置进行比较。

6.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中：

该第一成像单元在第一放大率水平下生成该多个时间序列图像；

该方法进一步包括针对该第一时间序列图像中描绘的该一个或多个候选对象中的每一个，由第二成像单元生成该孔的包含该候选对象的一部分的放大图像，该第二成像单元提供高于该第一放大率水平的第二放大率水平；并且

确定该候选对象是否为单个细胞包括通过使用该卷积神经网络分析该放大图像来确定该候选对象是否为单个细胞。

7.如权利要求6所述的方法，其中，生成该放大图像包括使该孔移位，使得该孔与该第二成像单元的光路对准。

8.如权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，确定该候选对象是否为单个细胞包括使用该卷积神经网络将该候选对象分类为多种可能对象类型之一，该多种对象类型包括与单个细胞相对应的类型。

9.如权利要求1至8中任一项所述的方法，其中，检测该第二时间序列图像中描绘的该细胞集落包括使用另一个卷积神经网络处理该第二时间序列图像。

10.如权利要求1至9中任一项所述的方法，其中：

该方法包括确定该细胞集落仅由一个细胞形成；并且

该方法进一步包括将细胞从该孔转运到新的培养环境；以及在该新的培养环境中培养该细胞。

11.如权利要求1至9中任一项所述的方法，其中：

该方法包括确定该细胞集落仅由一个细胞形成；并且

该方法进一步包括使用该孔的内容物来发展用于生产生物制药产品的细胞系。