[发明专利]乳腺癌的预测和预后方法在审
申请号: | 201980078015.0 | 申请日: | 2019-09-26 |
公开(公告)号: | CN113383091A | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | M·莱布尔;M·厄德;R·沃茨 | 申请(专利权)人: | 百欧恩泰诊断有限责任公司;斯卓蒂费尔分子病理学有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司 11285 | 代理人: | 孙占华;姜建成 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳腺癌 预测 预后 方法 | ||
1.预测乳腺癌患者在新辅助化疗后病理完全缓解(pCR)的可能性的方法,所述方法包括:
基于以下来计算未标度化的评分(su):通过逆转录定量PCR(RT-qPCR)测定的乳腺癌患者的治疗前乳腺肿瘤样本中ERBB2、ESR1、PGR和MKI67的mRNA的相对表达水平,其中
a)较高的评分su表示较高的pCR可能性,其中较高的ERBB2的mRNA的相对表达水平与较高的su相关,较高的ESR1的mRNA的相对表达水平与较低的su相关,较高的PGR的mRNA的相对表达水平与较低的su相关,且较高的MKI67的mRNA的相对表达水平与较高的su相关;或
b)较低的评分su表示较高的pCR可能性,其中较高的ERBB2的mRNA的相对表达水平与较低的su相关,较高的ESR1的mRNA相对表达水平与较高的su相关,较高的PGR的mRNA的相对表达水平与较高的su相关,且较高的MKI67的mRNA的相对表达水平与较低的su相关。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法包括:在计算su之前,通过RT-qPCR测定治疗前乳腺肿瘤样本中的ERBB2、ESR1、PGR和MKI67的mRNA的相对表达水平。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述新辅助化疗包括给予紫杉烷。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中如果所述乳腺癌是ERBB2-阳性乳腺癌,则所述新辅助化疗伴随抗-ERBB2药物的给药。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述乳腺癌为i)管腔型乳腺癌和/或ii)ESR1-和/或PGR-阳性乳腺癌。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,在su的计算中,ERBB2、ESR1、PGR和MKI67的mRNA的相对表达水平(REL)权重如下:
REL(ERBB2):REL(ESR1):REL(PGR):REL(MKI67)=0.35(±0.05):1(±0.15):0.39(±0.06):1.53(±0.23);或
REL(ERBB2):REL(ESR1):REL(PGR):REL(MKI67)=0.41(±0.06):1(±0.15):0.23(±0.03):1.76(±0.26)。
7.根据权利要求6所述的方法,其中较高的评分su表示较高的pCR可能性,且其中su通过使用以下公式计算:
su=基线+WF(ERBB2)·REL(ERBB2)-WF(ESRl)·REL(ESRl)-WF(PGR)·REL(PGR)+WF(MKI67)·REL(MKI67),
其中WF(ERBB2)为REL(ERBB2)的权重因子,WF(ESRl)为REL(ESRl)的权重因子,WF(PGR)为REL(PGR2)的权重因子,且WF(MKI67)为REL(MKI67)的权重因子。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中较高的评分su表示较高的pCR可能性,且其中su通过使用以下公式计算:
su=-6.394+0.099·REL(ERBB2)-0.279·REL(ESRl)-0.108·REL(PGR)+0.426·REL(MKI67);或
su=-13.413+0.117·REL(ERBB2)-0.288·REL(ESRl)-0.067·REL(PGR)+0.508·REL(MKI67)。
9.根据权利要求6所述的方法,其中较低的评分su表示较高的pCR可能性,且其中su通过使用以下公式计算:
su=-基线-WF(ERBB2)·REL(ERBB2)+WF(ESRl)·REL(ESRl)+WF(PGR)·REL(PGR)-WF(MKI67)·REL(MKI67),
其中WF(ERBB2)为REL(ERBB2)的权重因子,WF(ESRl)为REL(ESRl)的权重因子,WF(PGR)为REL(PGR2)的权重因子,且WF(MKI67)为REL(MKI67)的权重因子。
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