[发明专利]核酸文库、肽文库及它们的用途

权利要求书

1.一种核酸文库，每种核酸包含编码肽的确定的核酸序列的编码区，所述肽具有25和110个氨基酸之间的长度，并且具有为选自一种或更多种生物体的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域的氨基酸序列；其中所述文库包含编码至少10,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少50种此类肽中的每一种肽的氨基酸序列是多于一种不同的此类天然存在的蛋白质中的不同蛋白质的氨基酸序列中的序列区域，并且其中每种编码的氨基酸序列的等电点(pI)大于8.0或小于6.0。

2.根据权利要求1中任一项所述的核酸文库，其中所述多于一种不同的天然存在的蛋白质中的每一种满足一个或更多个预定标准。

3.根据权利要求2所述的核酸文库，其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种与给定的疾病诸如癌症相关。

4.根据权利要求3所述的核酸文库，其中所述疾病是乳腺癌。

5.根据权利要求2所述的核酸文库，其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质是细胞质蛋白质。

6.根据权利要求5所述的核酸文库，其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质是细胞质激酶。

7.根据权利要求2所述的核酸文库，其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质与给定的蛋白质或来自蛋白质(功能)类中的至少一种蛋白质相互作用。

8.根据权利要求7所述的核酸文库，其中所述多于一种天然存在的蛋白质中的每一种蛋白质与KRas相互作用。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的核酸文库，其中所述文库包含编码至少50,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少100种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少100种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域；特别地，其中所述文库包含编码至少100,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少150种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少150种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。

10.根据权利要求1至9中任一项所述的核酸文库，其中所述文库包含编码至少10,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少1,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是此类多于一种不同的天然存在的蛋白质的不同蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。

11.根据权利要求1至10中任一项所述的核酸文库，其中所述文库包含编码至少200,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少20,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少20,000种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域；特别地，其中所述文库包含编码至少300,000种不同的此类肽中的多于一种肽的核酸，并且其中至少25,000种此类肽的每一种肽的氨基酸序列是至少25,000种不同的天然存在的蛋白质的氨基酸序列中的序列区域。

12.根据权利要求1或11任一项所述的核酸文库，其中对于至少约1％的天然存在的蛋白质，多于一种所述核酸编码来自此类天然存在的蛋白质的氨基酸序列的不同肽。

13.根据权利要求12所述的核酸文库，其中对于至少约50％的天然存在的蛋白质，多于一种所述核酸编码来自此类天然存在的蛋白质的氨基酸序列的不同肽。

14.根据权利要求13所述的核酸文库，其中所述多于一种核酸编码不同的肽，并且所述不同的肽的氨基酸序列是沿着所述天然存在的蛋白质的氨基酸序列间隔的序列区域。