[发明专利]脱氧核糖核酸编码化方法及其编码化方法的医药生命工程用途

说明书

本发明涉及一种脱氧核糖核酸(DNA)的密码标准化方法，其包括：步骤(a)，将C、T、A、G的4种碱基分别命名为00、01、10、11；以及步骤(b)，当各碱基形成G和C以及A和T的碱基对时，在从5′到3′的方向，分别在G和C的情况下命名为1100，在C和G的情况下命名为0011，在A和T的情况下命名为1001，在T和A的情况下命名为0110，在本发明的脱氧核糖核酸密码标准化方法中，提供容易掌握碱基序列内的特定模式及二级结构、碱基序列变异等的方法，提供利用单核苷酸多态性(SNP)等的疾病特异性序列变异来容易预测疾病等的能够容易掌握脱氧核糖核酸片段或适配体等的在碱基序列内存在的特定模式的方法。

技术领域

本发明涉及脱氧核糖核酸(DNA)的密码标准化方法及其方法的最优化的医药生命工程用途。

背景技术

在生物体中以遗传物质存在的脱氧核糖核酸(DNA，DeoxyriboNucleic Acid)由通过蛋白质表达的基因部位和非基因部位构成。在脱氧核糖核酸的化学结构中，在作为脱氧核糖(Deoxyribose)的戊糖的5′碳连接磷酸基且在1′碳连接碱基(base)来形成称为核甘酸(Nucloeotide)的单体，此时，根据与核甘酸连接的碱基的种类确定脱氧核糖核酸的序列。

碱基的种类分为2种类型，具有环状结构为2个的嘌呤碱基和环状结构为1个的嘧啶类。嘌呤类具有鸟嘌呤(G)和腺嘌呤(A)，嘧啶类具有胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)等，在核糖核酸(RNA)的情况下，具有如下差异，即，戊糖的2′碳与-OH基连接，碱基的组成被尿嘧啶(U)取代，而不是被胸腺嘧啶取代。嘌呤类的G通过氢键与作为嘧啶的C形成互补对，A与T形成对。此时，G与C的互补结合通过3个氢键连接，因此，形成与形成2个氢键的A与T的结合相比强的键合。

在脱氧核糖核酸的核甘酸单体中，与5′碳连接的磷酸基通过磷酸双酯键(Phosphodiester bond)与另一单体的3′碳-OH基连接来形成单链。通过磷酸双酯键连接的2个互补单链通过互补碱基的氢键形成双螺旋结构。这种双螺旋结构在1953年由Watson和Crick介绍。[Watson，J.D.，Crick，F.H.(1953).Molecular structure of nucleicacids.Nature，171(4356)，737-738.]

在脱氧核糖核酸中的基因部位的碱基序列中，3个碱基密码被翻译为构成蛋白质的一个氨基酸(Amino acid)并连接，由此在合成蛋白质时起到重要作用。脱氧核糖核酸转录为信使核糖核酸(mRNA)后，根据碱基序列的顺序翻译成20种氨基酸，被翻译的氨基酸通过转运核糖核酸(tRNA)连接并形成蛋白质，由此作为细胞内的组合物质存在，并起到介导体内各种反应的酶的作用。

在人的脱氧核糖核酸的情况下，具有30亿个碱基对(bp)，每人具有GB单位的数据容量。若将该容量换算成人口数量，则PB单位也不够。因此，与分析人的所有脱氧核糖核酸序列(DNA sequence)相比，分析疾病特异性单核苷酸多态性(Single Nucleotidepolymorphism，碱基多态性)位点等，来利用短的脱氧核糖核酸片段的序列(sequence)预测分析疾病，即使这样也无法分析所有基因的单核苷酸多态性位点，由此需要用于分析其的各种程序。

现有专利文献

韩国公开专利：10-2016-0001455

发明内容

技术问题

本发明使为了解决上述问题且根据上述需要提出的，本发明的目的在于，提供如下的最优化的方法：将脱氧核糖核酸碱基标准化为考虑各碱基的分子量的二进制密码(每1个碱基为2bit)，由此掌握存在于碱基序列内的特定模式。

本发明地再一目的在于，提供利用碱基序列的密码之和来掌握是否互补结合及模式的方法，提供容易预测脱氧核糖核酸片段或脱氧核糖核酸适配体的模式及功能的方法。