[发明专利]亲和试剂的设计和选择

权利要求书

1.一种鉴定针对表位的亲和试剂的方法，其包括：

获得包含第一多个肽的第一肽文库，每个肽包含式αXβ的序列，其中X是所需表位，并且其中α和β是包含已知氨基酸序列的侧翼结构域；

将所述第一肽文库暴露于多种亲和试剂，从而使所述多种亲和试剂中的至少一种亲和试剂与所述第一肽文库结合；

确定与所述第一多个肽结合的所述至少一种亲和试剂的一个或多个序列，从而形成缩减的亲和试剂池；

获得包含第二多个肽的第二肽文库，每个肽包含式γXδ的序列，其中X是所需表位，并且其中γ和δ是包含已知氨基酸序列的侧翼结构域；

将所述第二肽文库暴露于所述缩减的亲和试剂池，从而使所述缩减的亲和试剂池中的至少一种亲和试剂与所述第二肽文库结合；以及

确定与所述第二肽文库结合的所述缩减的亲和试剂池中的至少一种亲和试剂的一个或多个序列，从而鉴定针对表位X的亲和试剂。

2.根据权利要求1所述的方法，其中α和β包含相同的氨基酸序列。

3.根据权利要求1所述的方法，其中α和β包含不同的氨基酸序列。

4.根据权利要求1所述的方法，其中α和β包含与γ和δ不同的氨基酸序列。

5.根据权利要求1所述的方法，其中α和β包含具有均一的化学多样性的氨基酸序列。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述具有均一的化学多样性的氨基酸序列包括包含两个或更多个具有等同电荷、疏水性、亲水性、空间大小、极性、分子结构或其组合的氨基酸侧基的氨基酸序列。

7.根据权利要求1所述的方法，其中α和β包含具有不均一的化学多样性的氨基酸序列。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述具有不均一的化学多样性的氨基酸序列包括包含两个或更多个具有不同电荷、疏水性、亲水性、空间大小、极性、分子结构或其组合的氨基酸侧基的氨基酸序列。

9.根据权利要求1所述的方法，其中γ和δ包含具有均一的化学多样性的氨基酸序列。

10.根据权利要求9所述的方法，其中所述具有均一的化学多样性的氨基酸序列包括包含两个或更多个具有等同电荷、疏水性、亲水性、空间大小、极性、分子结构或其组合的氨基酸侧基的氨基酸序列。

11.根据权利要求1所述的方法，其中γ和δ包含具有不均一的化学多样性的氨基酸序列。

12.根据权利要求11所述的方法，其中所述具有不均一的化学多样性的氨基酸序列包括包含两个或更多个具有不同电荷、疏水性、亲水性、空间大小、极性、分子结构或其组合的氨基酸侧基的氨基酸序列。

13.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括洗涤与所述第一肽文库结合的所述多种亲和试剂中的所述至少一种亲和试剂。

14.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括洗涤与所述第二肽文库结合的所述缩减的亲和试剂池中的所述至少一种亲和试剂。

15.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一或第二肽文库内的肽处于天然状态。

16.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一或第二肽文库内的肽处于非天然状态。

17.根据权利要求1所述的方法，其中所述非天然状态是变性状态或部分折叠状态。

18.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种亲和试剂与多于一个表位结合。