[发明专利]一种基于CT序列图像的腰椎骨自动定位方法有效
申请号: | 202010002600.7 | 申请日: | 2020-01-02 |
公开(公告)号: | CN111325754B | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 李立;王瑾;郝静毅 | 申请(专利权)人: | 武汉大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06N3/0455;G06N3/0464;G06N3/08 |
代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 42102 | 代理人: | 唐万荣 |
地址: | 430072 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 ct 序列 图像 腰椎 自动 定位 方法 | ||
1.一种基于CT序列图像的腰椎骨自动定位方法,其特征在于,该方法包括以下步骤,步骤一,载入横断位CT序列图像,对DICOM原始数据进行预处理,三维重建出骨骼增强冠状图;基于横断位CT序列图像三维重建出骨骼增强冠状图的方法包括以下步骤:
步骤A,此处的CT序列图像指的是做胸腹部CT检查获取的横断位CT序列图像,至少包括最后一节胸椎骨T12和第一节腰椎骨L1;
步骤B,获取CT序列图像即DICOM图像的头文件标签字段INSTANCENUMBER,对序列图片进行排序以符合CT扫描的时间顺序;
步骤B,根据DICOM图像数据进行灰度值统计确定骨骼区域灰度值阈值;
步骤D,根据DICOM图像数据进行灰度值统计确定金属物灰度值阈值,通过阈值限定消除可能存在的金属物影响;
步骤E,确定有效DICOM图像数据范围,设置遍历范围,消除CT机床床板产生的影响;
步骤F,基于以上步骤,按CT扫描顺序遍历处理每一张DICOM图像,提取骨骼部分的有效数据三维重建出骨骼冠状图,DICOM图像的CT序列号即所生成冠状图的行号;
步骤二,基于多尺度模板匹配的方法自动匹配胸椎骨T12,提取匹配胸椎骨T12的CT起始序列号n0;
步骤三,基于深度学习网络,训练基于横断位CT图像的腰椎骨分割模型;
步骤四,将n0作为起始序列号,用训练好的模型进行横断位图像腰椎骨分割并保存分割结果;
步骤五,基于横断位图像腰椎骨分割结果的像素总和,分离椎间盘和椎体,提取每一节腰椎骨对应的CT序列号区间;分离椎间盘和椎体,提取腰椎骨对应序列号区间的方法包括以下步骤:
步骤a),计算自n0开始每一张CT图片的分割结果进行像素总和统计;
步骤b),绘制分割结果对应的CT序列号与分割结果对应的像素总和间的曲线图;
步骤c),设置分离椎体和椎间盘的像素总和阈值,对曲线图进行二值化处理,生成类似方波的曲线;
步骤d),方波高值对应的序列号区间依次对应包含胸椎骨T12,腰椎骨L1,L2,L3,L4,L5所在CT图片的序列号区间。
2.根据权利要求1所述的基于CT序列图像的腰椎骨自动定位方法,其特征在于,所述步骤二中,多尺度模板匹配的方法包括以下步骤:
步骤a,以任意骨骼冠状图中第一节腰椎骨L1和最后一节胸椎骨T12及相连的肋骨区域作为特征模板;
步骤b,将生成的骨骼冠状图和特征模板二值化;
步骤c,将二值化的特征模板与骨骼冠状图进行多尺度模板匹配,并对匹配区域绘制矩形框;
步骤d,返回矩形右上角顶点的纵坐标,即胸椎骨T12的起始CT序列号n0。
3.根据权利要求1或2所述的基于CT序列图像的腰椎骨自动定位方法,其特征在于,所述步骤三中,基于深度学习训练基于横断位CT图片的椎骨分割模型的方法包括以下步骤:
步骤1,获取若干例胸腹部CT扫描数据,选取包含腰椎骨的DICOM图像转化为PNG格式作为训练集图片;
步骤2,将除皮质骨外椎骨骨小梁区域作为ROI对训练集图片进行标注,生成训练标签图片;
步骤3,选取全卷积神经网络,以全卷积神经网络FCN为底层特征提取结构;
步骤4,基于深度学习UNET网络进行训练,调整训练参数,得到基于横断位CT图片的椎骨分割模型;
步骤5,利用新样本对椎骨分割模型进行测试,得到测试结果。
4.根据权利要求1或2所述的基于CT序列图像的腰椎骨自动定位方法,其特征在于,所述步骤四中用训练好的模型进行腰椎骨分割的方法,包括以下步骤:
步骤1),将从n0开始的CT序列DICOM图像转化为PNG格式;
步骤2),利用训练好的分割模型从n0开始对PNG格式图片进行提取分割;
步骤3),保存分割结果。
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