[发明专利]一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用有效
| 申请号： | 202010006023.9 | 申请日： | 2020-01-03 |
| 公开（公告）号： | CN111088327B | 公开（公告）日： | 2022-09-13 |
| 发明（设计）人： | 黄永震;刘贤;梁爽爽;蔡雯雯;张子敬;于翔;施巧婷;文逸凡;贺花;茹宝瑞;胡沈荣;雷初朝;陈宏 | 申请（专利权）人： | 西北农林科技大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6851 | 分类号： | C12Q1/6851;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人： | 范巍 |
| 地址： | 712100 陕*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 sike1 基因 cnv 标记 辅助 检测 黄牛 性状 方法 及其 应用 | ||
1.一种检测黄牛
以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增
所述的
所述的拷贝数变异类型是根据-ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，-ΔΔCt0.5；缺失型，-ΔΔCt-0.5；正常型，-0.5≤-ΔΔCt ≤0.5；
所述的引物对P1为：
上游引物F1：5’-TTCCACCCAAAGTGTGGATGTT-3’
下游引物R1：5’-CTGCCTCCTGAATGGAACTGT-3’
所述的引物对P2为：
上游引物F2：5’- AACCAGGAGAAACTCGCCAA -3’
下游引物R2：5’- TTCGGTGAAATGCCCTCTCG -3’；
所述黄牛为云岭牛；具有缺失型拷贝数变异类型的个体在生长性状上优于具有正常型、插入型拷贝数变异类型的个体；
所述的生长性状为胸围、胸宽、胸深、尻长中的一种或多种。
2.如权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的扩增体系包括：50ng/μL模板DNA 1μL以及10μmol/L的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各0.5μL。
3.如权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的反应程序为：95℃预变性1 min；95℃变性15 s，60℃退火15 s，共40个循环。
4.如权利要求1所述的应用，其特征在于：基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为125bp，基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为166 bp。
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