[发明专利]一种筛查前列腺癌的试剂盒及方法在审
申请号: | 202010007400.0 | 申请日: | 2020-01-04 |
公开(公告)号: | CN110923328A | 公开(公告)日: | 2020-03-27 |
发明(设计)人: | 沈菲;李琳琳;陈汉奎;党琼;黄仲曦;汪佳宏;李高生 | 申请(专利权)人: | 广州中鑫基因医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 广州一锐专利代理有限公司 44369 | 代理人: | 杨昕昕;甘奎强 |
地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 前列腺癌 试剂盒 方法 | ||
1.一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,包括:ERG引物及其探针、SPDF引物及其探针、MAX引物及其探针、IL32引物及其探针、PDGFA引物及其探针;内对照为SPK引物及其探针。
2.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述ERG引物及其探针为:
上游引物ERG-F GCGTCCTCAGTTAGATCCTTATCAG
下游引物ERG-R CTGGCCACTGCCTGGATT
探针:
Probe1 FAM-CTTGGACCA/ZEN/ACAAGTAGCCGCCTTGC-BHQ1。
3.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述SPDEF引物及其探针为:
上游引物SPDEF-F CCACCTGGACATCTGGAAG
下游引物SPDEF-R CTGGCCACTGCCTGGATT
探针:Probe2 VIC-CGGCCTGGA/ZEN/TGAAAGAGCG -BHQ1。
4.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述MAX引物及其探针为:
上游引物MAX-F AAGGGATGAGACTATGTG
下游引物MAX-R GGAGATAATGTTGAGTGC
探针:Probe3 CY5-CCTAACATCCACAGAGACATTGCTTG-BHQ2。
5.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述IL32引物及其探针为:
上游引物IL32-F CTCTCTCGGGTAAGTCTC
下游引物IL32-R CCTGGCACAAATACTCAG
探针:Probe4 FAM-TCTCTGTCTGTCTCTGTCTCTGTCT-BHQ1。
6.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述PDGFA引物及其探针为:
上游引物PDGFA -F TTGGGTAAAGATTTGTGATTA
下游引物PDGFA -R TCCTGTGGTTAGATTAGAC
探针:Probe5 CY5-CAAGAAGCATCCAACCTGAGCC-BHQ2。
7.根据权利要求1所述的一种筛查前列腺癌的试剂盒,其特征在于,所述SPK引物及其探针为:
上游引物SPK-F CCTTGAACCATTATGCTG
下游引物SPK-R CCGATACTTCTCACTCTC
探针:Probe6 VIC-ACCAATGAAGACCTCCTGACCAA-BHQ1。
8.一种筛查前列腺癌的方法,其特征在于,
S10.提取尿液样品的外泌体;
S20.提取外泌体的RNA,得到外泌体的mRNA;
S30.对mRNA进行RT-PCR,得到cDNA;
S40.对cDNA进行qPCR,采用权利要求1~3中任一项所述的试剂盒;
S50.获取SPK基因的及ERG、SPDEF、MAX、IL32、PDGFA的CT值,若SPK基因的CT值<36,且其余5种基因中任一种基因的CT值<36,则前列腺癌风险高。
9.根据权利要求8所述的一种筛查前列腺癌的方法,其特征在于,所述提取尿液样品的外泌体的方法为:
S11.将样品在室温下2800~3200g离心10~20min;
S12.取上清液15~25ml,加入3~5ml外泌体提取试剂,充分混匀,4℃放置12~24h,得到混合液;
S13.将混合液在4℃下6000~8000g离心20~40min;
S14.去除上清液,残留物在4℃下6000~8000g离心3~7min,彻底去除上清液,得到的沉淀即为外泌体。
10.根据权利要求8所述的一种筛查前列腺癌的方法,其特征在于,所述qPCR包括:
S41.取PCR mix20~30μL,5~15μM第一引物混合物3~6μL,5~15μM第一探针混合物0.3~3μL,NF水9~12μL,混匀得到第一反应液;取取PCR mix20~30μL,5~15μM第二引物混合物3~6μL,5~15μM第二探针混合物0.3~3μL,NF水9~12μL,混匀得到第二反应液;所述第一引物混合物包括ERG引物1~2μL、SPDEF引物1~2μL、MAX引物1~2μL,所述第一探针混合物包括ERG探针0.1~1μL、SPDEF探针0.1~1μL、MAX探针0.1~1μL的探针;所述第二引物混合物包括IL32引物1~2μL、PDGFA引物1~2μL、SPK引物1~2μL,所述第二探针混合物包括IL32探针0.1~1μL、PDGFA探针0.1~1μL、SPK探针0.1~1μL的探针
S42.将第一反应液、第二反应液注入不同的反应孔中,分别向第一、第二反应液中加入cDNA5~10μL,混匀;
S43.控制PCR条件为:在90~95℃下保持2~5min;再90~95℃3~10s,50~60℃10~20s,70~75℃20~40s,循环35~45次。
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