[发明专利]一种染色体切割数据的处理方法、系统和存储介质

说明书

本发明公开了一种染色体切割数据的处理方法、系统和存储介质，所述方法包括以下步骤：获取染色体原图；对染色体原图进行分类，得到单条染色体图像作为第一图像和染色体簇图像；对染色体簇图像进行实例分割，得到染色体簇图像内每条染色体的掩码；通过每条染色体的掩码从染色体簇图像中获取单条染色体对应的像素值；根据每条染色体对应的像素值生成染色体簇图像的单条染色体图像作为第二图像；将第一图像和第二图像进行融合，得到所有单条染色体组成的染色体排列图。本发明能对存在染色体交叉或重叠的染色体图像进行准确分割，提高医生对染色体分类和核型分析的准确度。本发明可应用于图像处理领域。

技术领域

本发明涉及图像处理领域，尤其是一种染色体切割数据的处理方法、系统和存储介质。

背景技术

染色体切割是染色体核型分析过程的一个重要阶段，染色体切割的结果将会直接影响到医生对染色体分类和核型分析的准确度。现有技术主要通过计算机辅助系统来完成染色体核型分析，但都不能实现完全自动化过程，需要大量的人工干预。在良好的成像条件下，现有的自动分类系统能够取得一定的准确度，但是，如果在图像中出现染色体相连、重叠或畸形时，分类错误率会显著提高。可见，对于原始图像直接进行分类的效果并不理想，关键还是要通过切割出单条的染色体才能获得较准确的分析结果。然而，现有的染色体图像切割方法，大多都是基于几何方法来实现的，对于存在染色体交叉或重叠的染色体图像，分割准确度大大降低。

发明内容

为解决上述技术问题，本发明的目的在于：提供一种染色体切割数据的处理方法、系统和存储介质，其能对存在染色体交叉或重叠的染色体图像进行准确分割，提高医生对染色体分类和核型分析的准确度。

本发明实施例的第一方面提供了：

一种染色体切割数据的处理方法，其包括以下步骤：

获取染色体原图；

对染色体原图进行分类，得到单条染色体图像作为第一图像和染色体簇图像；

对染色体簇图像进行实例分割，得到染色体簇图像内每条染色体的掩码；

通过每条染色体的掩码从染色体簇图像中获取单条染色体对应的像素值；

根据每条染色体对应的像素值生成染色体簇图像的单条染色体图像作为第二图像；

将第一图像和第二图像进行融合，得到所有单条染色体组成的染色体排列图。

进一步地，所述对染色体原图进行分类，得到单条染色体图像作为第一图像和染色体簇图像，包括以下步骤：

对染色体原图进行连通域标记，得到染色体切片图像；

获取第一阈值和第二阈值；

计算染色体切片与染色体原图的像素比值；

判断像素比值是否大于第一阈值，若是，则判定染色体切片图像为第一待识别图像，反之，则判定染色体切片图像为单条染色体图像；

计算第一待识别图像对应的长短轴比值；

判断长短轴比值是否小于第二阈值，若是，则判定第一待识别图像为第二待识别图像，反之，则判定第一待识别图像为单条染色体图像；

获取第二待识别图像的端点个数；

判断端点个数是否大于两个，若是，则判定第二待识别图像为染色体簇图像，反之，则判定第二待识别图像为单条染色体图像。

进一步地，所述对染色体原图进行分类，得到单条染色体图像作为第一图像和染色体簇图像，包括以下步骤：

对染色体原图进行连通域标记，得到染色体切片图像；

获取第一阈值；