[发明专利]一种核糖体印记测序数据分析方法及系统

权利要求书

1.一种核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，包括如下操作：

对测序数据进行筛选，并可视化展示结果；

将数据筛选结果进行比对，保留目标reads；

将所述比对的结果进行RFs分布分析；

将获得的目标reads进行编码基因的统计；

将获得的目标reads编码基因进行表达差异分析。

2.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述“对测序数据进行筛选”包括测序数据的过滤和质量评估；

所述过滤包括：去除含有接头的reads、去除全部都是A碱基的reads、去除含N比例大于10％的reads和去除低质量的reads；

所述质量评估包括：将各类过滤的reads以及高质量reads占总reads的比例通过图示化展示，以及对过滤后的数据通过绘制碱基组成和质量值分布图，来直观地看数据质量情况。

3.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述“将数据筛选结果进行比对，保留目标reads”的操作中，所述比对包括：比对去除核糖体RNA、比对去除转运RNA、比对去除snoRNA、snRNA、miRNA，最后保留比对至参考基因组的reads。

4.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述“将所述比对的结果进行RFs分布分析”的操作中，所述RFs分布分析包括：核糖体印记在编辑基因上的分布分析、核糖体印记在起始和终止密码子周边的分布分析、核糖体印记比对密码子位置的分布分析。

5.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述的“将获得的目标reads进行编码基因的统计”包括：基因表达结果统计、基因覆盖度统计和基因表达量统计。

6.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述的“将获得的目标reads编码基因进行表达差异分析”包括：分组间差异翻译统计、表达模式聚类分析和差异基因GO/Pathway富集分析。

7.根据权利要求1所述的核糖体印记测序数据的处理方法，其特征在于，所述核糖体印记测序数据的处理方法还包括：两组学关联分析；

所述两组学关联分析包括：结合样本RNA-seq或lncRNA-seq，进行了如权利要求1所述的分析后，再进行基因翻译表达量与转录表达量相关性分析、翻译差异和转录差异比较分析、翻译效率分析和TE差异与转录差异比较分析。

8.一种核糖体印记测序数据处理系统，其特征在于，所述的系统具体包括：

测序数据筛选单元，用于筛选原始测序数据；

对比分析单元，用于对筛选所得的测序数据进行比对分析，以找出目标reads；

RFs分布分析单元，用于将获得的比对分析数据结果进行RFs分布分析；

编码基因统计单元；所述编码基因统计单元实现的统计任务包括：基因表达结果统计、基因覆盖度统计、基因表达量统计；

表达差异分析单元；所述表达差异分析单元实现的份吸任务包括：分组间差异翻译统计分析、表达模式聚类分析、差异基因GO/Pathway富集分析。

9.根据权利要求8所述的核糖体印记测序数据处理系统，其特征在于，所述系统还包括：两组学关联分析单元。

10.一种核糖体印记测序数据处理平台，其特征在于，包括：

处理器、存储器以及核糖体印记测序数据处理控制程序；

其中在所述的处理器执行所述的核糖体印记测序数据处理平台控制程序，所述的核糖体印记测序数据处理平台控制程序被存储在所述的存储器中，所述的核糖体印记测序数据处理平台控制程序，实现如权利要求1至9中任一项所述的核糖体印记测序数据处理方法步骤。

11.一种计算机可读取存储介质，其特征在于，所述计算机可读取存储介质存储有核糖体印记测序数据处理平台控制程序，所述的核糖体印记测序数据处理平台控制程序，实现如权利要求1至7中任一项所述的核糖体印记测序数据处理方法步骤。