[发明专利]一种交互式细胞异质性分析可视化平台及其实现方法

权利要求书

1.一种交互式细胞异质性分析可视化平台，包括：

细胞亚群分类分析模块，用于接收用户上传的数据，利用R包Seurat降维，并将转录本信息相似的单细胞聚类分群，将样本分为若干个细胞亚群，进行可视化展示；

亚群marker基因分析模块，用于利用R包Seurat调用平台分析程序可视化展示有效基因在不同细胞亚群的表达情况，获得marker基因在各细胞亚群的表达情况，并进行可视化展示，以用于细胞亚群鉴定；

亚群上调基因分析模块，用于利用R包Seurat调用平台分析程序获取亚群上调基因分布表格，并调用平台分析程序展示亚群上调基因在细胞亚群的分布情况。

2.如权利要求1所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述细胞亚群分类分析模块接收用户上传的质控后数据，利用R包Seurat调用平台分析程序寻找高变基因，再以PCA算法降维；然后利用显著性主成分构建基于图论的聚类关系图，将转录本信息相似的单细胞聚类分群，并使用Louvain算法优化细胞聚类结果，将样本分为若干个细胞亚群，完成细胞亚群分类。

3.如权利要求2所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述细胞亚群分类分析模块的可视化展示为堆叠图，并提供一键式参数切换界面提供用户交互的参数切换以及修改样本名称和顺序。

4.如权利要求3所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述参数切换是指一键式选择横坐标以样本为单位展示或以分组为单位展示，一键式选择纵坐标以绝对值或以百分比值展示。

5.如权利要求2所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述细胞亚群分类分析模块的可视化展示为t-SNE图，并提供一键式参数切换界面提供用户交互的参数切换、修改亚群名称以及根据不同信息选择t-SNE图的展示内容。

6.如权利要求5所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述参数切换包括亚群和样本两大类，所述根据不同信息选择t-SNE图的展示内容包括以亚群信息展示的t-SNE图、以样本信息展示的t-SNE图、以转录本信息展示的t-SNE图。

7.如权利要求1所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述亚群marker基因分析模块的可视化展示包括但不限于t-SNE图、小提琴图、热图展示。

8.如权利要求1所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述亚群上调基因分析模块使用t-SNE图和小提琴图展示亚群上调基因在细胞亚群的分布情况。

9.如权利要求1所述的一种交互式细胞异质性分析可视化平台，其特征在于：所述平台还包括细胞亚群再分类模块，用于选择亚群和分析项目并于接收到重分析请求信号时重新调用所述细胞亚群分类分析模块、亚群marker基因分析模块以及亚群上调基因分析模块进行细胞亚群分类分析、亚群marker基因分析、亚群上调基因分析。

10.一种交互式细胞异质性分析方法，包括如下步骤：

步骤S1，接收用户上传的数据，利用R包Seurat降维，并将转录本信息相似的单细胞聚类分群，将样本分为若干个细胞亚群，进行可视化展示；

步骤S2，利用R包Seurat调用平台分析程序可视化展示有效基因在不同细胞亚群的表达情况，获得marker基因在各细胞亚群的表达情况，并进行可视化展示，以用于细胞亚群鉴定；

步骤S3，利用R包Seurat调用平台分析程序获取亚群上调基因分布表格，并调用平台分析程序展示亚群上调基因在细胞亚群的分布情况。