[发明专利]一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用和获取方法

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用和获取方法，本申请的方法通过提取猪的总DNA，对总DNA进行质量控制、分析得到基因型数据，对比猪参考基因组序列获得基因分型数据，得到一种与猪体重相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在该序列的第51位的碱基处存在一个T/G的等位基因突变，导致所示序列的核苷酸产生多态性，当SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸为T时，猪体重更重。

【技术领域】

本发明涉及猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用。

【背景技术】

在生产中，猪的体重与经济效益密切相关，一些重要的生产成本是以每只猪为单位计算产生的，如部分环境管理成本，而猪的屠宰体重越重，这部分成本就能得以节省。有研究表明，猪的体重与肉质性状和胴体性状存在相关，在一定阶段内，猪的体重与眼肌面积呈极显著正相关。同时有研究发现，母猪体重与繁殖性能存在相关，适宜的体重能保证母猪最高的繁殖性能。因此，探索发现猪体重的相关分子标记有助于实际生产和更好的展开猪的育种研究。

全基因组关联分析,即在全基因组范围上寻找变异位点—单核苷酸多态性(SNPs)，并从中筛选出与表型性状相关联的SNPs。随着各种生物全基因组测序的完成和高通量芯片不断的研发，GWAS在人的疾病性状和畜禽，植物的经济性状等的研究中得到了广泛应用，并取得了新的进展。目前GWAS已经在猪上的生长，肉质等性状的研究取得了新进展，证明了GWAS在猪上研究的适用性。

本专利通过整合NCBI数据库(SRA,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/)和欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI,https://www.ebi.ac.uk/)中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据，使用MVP软件，利用混合线性模型(MLM)，筛选出与体重相关的SNP分子标记，为猪体重的辅助选择和预测改良提供了新的分子标记基础，对于猪的育种具有重要意义。

本发明筛选的SNP分子标记与猪体重呈显著相关，为猪的体重相关研究提供了新的遗传资源。

【发明内容】

鉴于上述内容，有必要提供一种与猪体重相关的SNP分子标记及其应用和获取方法，第14号染色体的第43416507核酸位点；为AC突变，根据该突变可设计出用于扩增该分子标记的引物和鉴定分子标记的探针；进而应用于筛选具有高体重的猪，为杜洛克猪体重的选择和提高提供了新的分子标记基础。

为达到上述目的，本发明所采用的技术方案是：

一种与猪体重相关的SNP分子标记，其特征在于，所述的分子遗传标记位于猪的第14号染色体的第43416507核酸位点，该位点的碱基为T或G，对应位于核酸序列表SEQ IDNO.1的第51位核酸位点。

本申请还包括用于扩增所述分子遗传标记的引物或鉴定所述分子遗传标记的探针。

本申请还包括含有所述引物或探针的试剂盒。

本申请还包括一种所述分子遗传标记在选育或辅助选育高或低体重品种或品系选育中的用途。

一种选育或辅助选育体重更重猪的方法，所述方法为：提取猪DNA，检测猪第14号染色体的第43416507位脱氧核糖核苷酸，测出第43416507位核苷酸的序列为T或G，确定待测猪的基因型是TT型或GG型，选择TT型基因的猪进行下一步选种和/或育种。

进一步的，所述TT基因型为猪第14号染色体的第43416507位脱氧核糖核苷酸为T的纯合体；GG基因型为第14号染色体的第43416507位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体。