[发明专利]一种甲基化标志物在辅助诊断癌症中的应用在审
| 申请号： | 202010062049.5 | 申请日： | 2020-01-19 |
| 公开（公告）号： | CN113136428A | 公开（公告）日： | 2021-07-20 |
| 发明（设计）人： | 王俊;狄飞飞;韦玉杰 | 申请（专利权）人： | 南京腾辰生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 张立娜 |
| 地址： | 210032 江苏省南京市江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 甲基化 标志 辅助 诊断 癌症 中的 应用 | ||
1.甲基化SLC22A18基因作为标志物在制备产品中的应用；所述产品的用途为如下中的至少一种：
(1)辅助诊断癌症或预测癌症患病风险；
(2)辅助区分良性结节和癌症；
(3)辅助区分癌症不同亚型；
(4)辅助区分癌症不同分期；
(5)辅助诊断肺癌或预测肺癌患病风险；
(6)辅助区分肺部良性结节和肺癌；
(7)辅助区分肺癌不同亚型；
(8)辅助区分肺癌不同分期；
(9)辅助诊断胰腺癌或预测胰腺癌患病风险；
(10)辅助诊断食管癌或预测食管癌患病风险；
(11)辅助区分肺癌和胰腺癌；
(12)辅助区分肺癌和食管癌；
(13)辅助区分胰腺癌和食管癌；
(14)确定待测物对癌症的发生是否存在阻碍或促进作用。
2.用于检测SLC22A18基因甲基化水平的物质在制备产品中的应用；所述产品的用途为如下中的至少一种：
(1)辅助诊断癌症或预测癌症患病风险；
(2)辅助区分良性结节和癌症；
(3)辅助区分癌症不同亚型；
(4)辅助区分癌症不同分期；
(5)辅助诊断肺癌或预测肺癌患病风险；
(6)辅助区分肺部良性结节和肺癌；
(7)辅助区分肺癌不同亚型；
(8)辅助区分肺癌不同分期；
(9)辅助诊断胰腺癌或预测胰腺癌患病风险；
(10)辅助诊断食管癌或预测食管癌患病风险；
(11)辅助区分肺癌和胰腺癌；
(12)辅助区分肺癌和食管癌；
(13)辅助区分胰腺癌和食管癌；
(14)确定待测物对癌症的发生是否存在阻碍或促进作用。
3.用于检测SLC22A18基因甲基化水平的物质和储存有数学模型建立方法和/或使用方法的介质在制备产品中的应用；所述产品的用途为如下中的至少一种：
(1)辅助诊断癌症或预测癌症患病风险；
(2)辅助区分良性结节和癌症；
(3)辅助区分癌症不同亚型；
(4)辅助区分癌症不同分期；
(5)辅助诊断肺癌或预测肺癌患病风险；
(6)辅助区分肺部良性结节和肺癌；
(7)辅助区分肺癌不同亚型；
(8)辅助区分肺癌不同分期；
(9)辅助诊断胰腺癌或预测胰腺癌患病风险；
(10)辅助诊断食管癌或预测食管癌患病风险；
(11)辅助区分肺癌和胰腺癌；
(12)辅助区分肺癌和食管癌；
(13)辅助区分胰腺癌和食管癌；
(14)确定待测物对癌症的发生是否存在阻碍或促进作用；
所述数学模型按照包括如下步骤的方法获得：
(A1)分别检测n1个A类型样本和n2个B类型样本的SLC22A18基因甲基化水平；
(A2)取步骤(A1)获得的所有样本的SLC22A18基因甲基化水平数据，按照A类型和B类型的分类方式，通过二分类逻辑回归法建立数学模型，确定分类判定的阈值；
所述数学模型的使用方法包括如下步骤：
(B1)检测待测样本的SLC22A18基因甲基化水平；
(B2)将步骤(B1)获得的所述待测样本的SLC22A18基因甲基化水平数据代入所述数学模型，得到检测指数；然后比较检测指数和阈值的大小，根据比较结果确定所述待测样本的类型是A类型还是B类型；
所述A类型样本和所述B类型样本为如下中的任一种：
(C1)肺癌样本和无癌对照；
(C2)肺癌样本和肺良性结节样本；
(C3)肺癌不同亚型样本；
(C4)肺癌不同分期样本；
(C5)肺癌样本和食管癌样本；
(C6)肺癌样本和胰腺癌样本；
(C7)胰腺癌样本和食管癌样本；
(C8)胰腺癌样本和无癌对照；
(C9)食管癌样本和无癌对照。
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