[发明专利]一种利用古菌分子标记OTU300快速检测城市绿地土壤全氮含量的方法

说明书

本发明公开了一种利用古菌分子标记OTU300快速检测城市绿地土壤全氮含量的方法。本发明提供了一种DNA分子(探针)，如序列表的序列1所示。本发明还保护所述探针在检测或辅助检测土壤全氮含量中的应用。本发明还保护所述探针在比较不同地块的土壤全氮含量中的应用。采用本发明提供的方法检测土壤全氮含量或比较不同地块的土壤全氮含量，具有如下优点：样品需求量小，无需前处理，所需时间短，人力成本低，可以实现对大批量样品的快速自动化检测。本发明对于土壤样品的测评具有重要应用推广价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种利用古菌分子标记OTU300快速检测城市绿地土壤全氮含量的方法。

背景技术

城市园林绿化建设是生态文明建设和美丽中国建设的重要组成部分，对优化城市环境，提高人民生活质量，促进城市可持续发展起着重要作用。城市绿地土壤作为城市生态环境的物质基础，其质量直接影响着植物的健康生长以及生态效益、景观功能的发挥，在一定程度上决定着城市绿地质量。因此，对城市绿地土壤质量进行科学客观的监测和评价，是城市绿地管理的重要参考和依据。

目前对城市绿地土壤质量指标的检测主要是沿用传统的理化检测方法，样品需求量大，样品前处理过程复杂、周期长，尤其所需要的人力资源成本较高，难以实现对大批量样品的快速检测。土壤微生物对土壤环境的变化具有综合性、敏感性和功能性的特点，探索通过检测特定微生物类群的丰度来实现对绿地土壤质量指标的快速和自动化检测技术具有重要的现实意义。

土壤全氮是土壤肥力质量的重要指标，土壤全氮包括所有形式的有机态和无机态氮，是标志土壤氮素总量和供应植物有效氮素的源和库，能够综合反映土壤氮素状况、评估土壤供氮能力。土壤全氮受成土母质、地形、气候、生物等自然因素以及绿化养护等人为因素共同影响，其在土壤中的分布表现出显著的空间异质性。土壤全氮已成为世界各国土壤质量分析和实验室测定的例行项目。

发明内容

本发明的目的是提供一种利用古菌分子标记OTU300快速检测城市绿地土壤全氮含量的方法。

本发明提供了引物探针组，由特异引物对和特异探针组成；所述特异引物对由序列表的序列4所示的引物524F-10-ext和序列表的序列5所示的引物Arch958R-mod组成；所述特异探针的核苷酸序列如序列表的序列1所示。所述特异探针为Taqman探针。所述Taqman探针的5’末端具有荧光基团，3’末端具有荧光淬灭基团。所述荧光基团具体可为FAM。所述荧光淬灭基团具体可为TAMRA。

本发明还保护所述引物探针组在检测或辅助检测土壤全氮含量中的应用。

本发明还保护所述引物探针组在比较不同地块的土壤全氮含量中的应用。

本发明还保护一种试剂盒，包括所述引物探针组。

所述试剂盒的功能为如下(a)或(b)：

(a)检测或辅助检测土壤全氮含量；

(b)比较不同地块的土壤全氮含量

所述试剂盒还包括记载有如下所述方法甲或方法乙的载体。

本发明还提供了一种DNA分子(探针)，如序列表的序列1所示。

本发明具体提供了一种Taqman探针，其核苷酸序列如序列表的序列1所示。所述Taqman探针的5’末端具有荧光基团，3’末端具有荧光淬灭基团。所述荧光基团具体可为FAM。所述荧光淬灭基团具体可为TAMRA。

本发明还保护所述DNA分子或所述Taqman探针在检测或辅助检测土壤全氮含量中的应用。

本发明还保护所述DNA分子或所述Taqman探针在比较不同地块的土壤全氮含量中的应用。

本发明还保护一种检测土壤全氮含量的方法(方法甲)，包括如下步骤：