[发明专利]一种利用古菌分子标记OTU127快速检测城市搬迁地土壤有效锰含量的方法

说明书

本发明公开了一种利用古菌分子标记OTU127快速检测城市搬迁地土壤有效锰含量的方法。本发明提供了一种DNA分子(探针)，如序列表的序列1所示。本发明还保护所述探针在检测或辅助检测土壤有效锰含量中的应用。本发明还保护所述探针在比较不同地块的土壤有效锰含量中的应用。采用本发明提供的方法检测土壤有效锰含量或比较不同地块的土壤有效锰含量，具有如下优点：样品需求量小，无需前处理，所需时间短，人力成本低，可以实现对大批量样品的快速自动化检测。本发明对于土壤样品的测评具有重要应用推广价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种利用古菌分子标记OTU127快速检测城市搬迁地土壤有效锰含量的方法。

背景技术

随着城市化的快速发展，目前我国城市，尤其是特大城市，已进入“城市再开发”为主导的城市发展阶段，城市搬迁地大量出现，在东部沿海经济发达地区的城市尤其明显。以上海为例，建成区范围内80％-90％的建设绿地都是在城中村拆迁、旧工厂搬迁等地块上开展的，对其土壤质量进行科学客观的监测和评价，是进行城市搬迁地生态修复和园林绿化的前提和重要参考依据。

目前对城市搬迁地土壤质量指标的检测主要是沿用传统的理化检测方法，样品需求量大，样品前处理过程复杂、周期长，尤其所需要的人力资源成本较高，难以实现对大批量样品的快速检测。土壤微生物对土壤环境的变化具有综合性、敏感性和功能性的特点，探索通过检测特定微生物类群的丰度来实现对城市搬迁地土壤质量指标的快速和自动化检测技术具有重要的现实意义。

锰是生物体的必需微量元素，对维持生物体正常的新陈代谢起着关键的作用；但是锰过量会对生物体生命代谢活动造成极大损害。土壤中的锰以多种形态存在，有效态锰包括水溶性锰、交换态锰和易还原态锰3类，有效态锰能够很好地反映土壤的供锰强度。土壤锰含量主要受土壤母质的影响，其有效态受土壤pH值和氧化还原电位的影响。

发明内容

本发明的目的是提供一种利用古菌分子标记OTU127快速检测城市搬迁地土壤有效锰含量的方法。

本发明提供了一种DNA分子(探针)，如序列表的序列1所示。

本发明具体提供了一种Taqman探针，其核苷酸序列如序列表的序列1所示。所述Taqman探针的5’末端具有荧光基团，3’末端具有荧光淬灭基团。所述荧光基团具体可为FAM。所述荧光淬灭基团具体可为TAMRA。

本发明还保护所述DNA分子或所述Taqman探针在检测或辅助检测土壤有效锰含量中的应用。

本发明还保护所述DNA分子或所述Taqman探针在比较不同地块的土壤有效锰含量中的应用。

本发明还保护引物探针组，由特异引物对和特异探针组成；所述特异引物对由序列表的序列4所示的引物524F-10-ext和序列表的序列5所示的引物Arch958R-mod组成；所述特异探针的核苷酸序列如序列表的序列1所示。所述特异探针为Taqman探针。所述Taqman探针的5’末端具有荧光基团，3’末端具有荧光淬灭基团。所述荧光基团具体可为FAM。所述荧光淬灭基团具体可为TAMRA。

本发明还保护所述引物探针组在检测或辅助检测土壤有效锰含量中的应用。

本发明还保护所述引物探针组在比较不同地块的土壤有效锰含量中的应用。

本发明还保护一种试剂盒，包括所述引物探针组。

所述试剂盒的功能为如下(a)或(b)：

(a)检测或辅助检测土壤有效锰含量；

(b)比较不同地块的土壤有效锰含量。

所述试剂盒还包括记载有如下方法甲或方法乙的载体。

本发明还保护一种检测土壤有效锰含量的方法(方法甲)，包括如下步骤：