[发明专利]一种用于预测大肠癌化疗效果的生物标志物、试剂盒及其应用

说明书

本发明首次指出单独检测血清外泌体中CACClnc的相对含量及利用大肠癌组织石蜡切片CACClnc的原位杂交染色评分在预测大肠癌患者化疗效果中的应用。本发明公开了一种预测大肠癌患者化疗效果的试剂盒，其特征在于，包括能够扩增CACClnc的特异性引物和/或能够检测CACClnc的特异性探针。与影像学检查或手术标本的TRG评分相比，基于CACClnc预测大肠癌患者化疗效果的方法具有实施较为方便，成本较低的特点，且能更早预测化疗效果，不仅在经济上，更在治疗方案的选择上使患者获益。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种检测血清外泌体及大肠癌组织中CACClnc相对含量的试剂盒以及其在预测大肠癌患者化学治疗效果中的应用。

背景技术

大肠癌是消化系统常见的恶性肿瘤，其致死率在恶性肿瘤中居前5位。近年来，随着生活水平的提高，在我国大肠癌的发病率也逐年增加。对于中晚期大肠癌患者，目前的一线化疗方案多为奥沙利铂、氟尿嘧啶或伊替立康^[1]。铂类药物杀伤肿瘤细胞的主要机制是在低氯的内环境中，铂原子形成水合阳离子，与DNA形成共价键，形成加合物，从而造成DNA发生链内和链内的交联，阻滞DNA的复制，最终导致细胞的死亡^[2]。氟尿嘧啶的杀伤肿瘤细胞的作用是通过在体内转化为氟尿嘧啶脱氧核苷酸，阻断脱氧核糖尿苷酸转化为胸苷酸，进而抑制DNA合成。因此，修复这种DNA损伤与肿瘤细胞的化疗耐药相关。由于化疗耐药，中晚期大肠癌患者的生存率不足10％^[3]。因此，尽早明确患者是否对化疗敏感至关重要。目前，判断肿瘤患者化疗效果的方法主要是通过影像学检查或者手术标本的肿瘤退缩分级(TRG)评分。大肠癌患者进行2-3个月化疗后通过CT、PET-CT、MR等影像学检查及肠镜判断肿瘤是否缩小^[1]。化疗后进行手术者，根据其手术标本的术后病理进行肿瘤退缩分级(TRG)评分，从而判断化疗效果，进而决定术后治疗方案。另外，还可在化疗后检测患者血清中癌胚抗原(CEA),监测患者化疗效果。

上述判断大肠癌患者化疗效果的方案均需要在化疗后方可明确是否有效，对于对化疗抵抗的患者来说，增加了无用的治疗成本，且影像学及肠镜等检查的成本较高。此外，对于化疗抵抗的患者而言，化疗几个疗程及手术之后判断化疗效果的影像学检查、术后病理肿瘤退缩分级(TRG)评分、血清癌胚抗原(CEA)需要的时间较长，可能会使化疗抵抗的患者错失其他治疗方案的时机。

因此，需要使用更加简便，成本更低，且能早期甚至在化疗前就能判断化疗是否有效的标志物，从而促进化疗效果并为大肠癌患者选择合适的治疗方法，提高大肠癌患者的生存率。

长链非编码RNA(LncRNA)是一种转录长度大于200nt，没有蛋白质编码功能的转录产物，能够在转录及转录后水平调控基因表达。近年来研究发现lncRNA参与肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭及血管新生等多种生物学功能。一些lncRNA还可以通过不同机制参与肿瘤细胞的化疗耐药。CACClnc(ENST00000534398)是与大肠癌相关的一条lncRNA，目前尚未有CACClnc与大肠癌化疗耐药相关的报道，也没有CACClnc可能用于预测大肠癌患者化疗效果的相关报道。

[1]NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology-Colon Cancer(2018Version2)[DB/OL].http://www.nccn.org.

[2]Helleday T,Petermann E,Lundin C,et al.DNA repair pathways astargets for cancer therapy.Nat Rev Cancer 2008；8:193-204.