[发明专利]用于区别自身免疫性肝炎和健康人群的肠道微生物标志物及其应用

权利要求书

1.一种用于区别自身免疫性肝炎和健康人群的肠道微生物基因标志物，其特征在于：包括SEQ ID NO:1-5中至少一种基因所示的微生物，所述微生物在肠道中明显富集或减少。

2.一种用于检测权利要求1所述肠道微生物基因标志物的检测试剂，包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-5中至少一种基因的引物。

3.根据权利要求2所述的检测试剂，其特征在于：所述引物序列为SEQ ID NO:6-7。

4.权利要求2所述检测试剂在制备自身免疫性肝炎和健康人群的区分检测试剂盒中的应用，所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的肠道微生物的基因。

5.权利要求2所述检测试剂在建立一种区别自身免疫性肝炎和健康人群的肠道微生物模型中的应用，所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的肠道微生物的基因。

6.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于：对所述对象的粪便进行检测，以便确定该样本是否包含所述的微生物基因，是否可以建立区别自身免疫性肝炎和健康人群的微生物基因模型。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于：通过收集入组对象的粪便样本，抽提微生物总DNA，进行肠道菌群的16S rDNA Miseq测序；基于高通量测序数据，在队列中建立自身免疫性肝炎和健康人群患者的微生物区别模型，建立自身免疫性肝炎患病率(probabilityof disease，POD)指数；POD指数可用于计算其区别能力，进行验证。

8.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于，具体包括：

(1)收集入组对象的粪便样本，入组对象包括37例自身免疫性肝炎患者和78例健康人，按照DNA的标准抽提方法完成粪便样本中微生物总DNA的抽提，在Illumina MiSeq平台完成肠道菌群的16S rDNA高通量测序工作；

(2)基于高通量测序数据，在微生物区别模型的队列中，在37例自身免疫性肝炎和78例健康人之间，基于一个随机森林模型，通过一个十倍交叉验证的算法，鉴定了用于该模型的最佳的5个微生物基因标志物；

(3)基于5个微生物基因标志物，通过使用随机生成的决策树的比率来计算自身免疫性肝炎患病率(Probability of disease,POD)指数；

(4)该微生物区别模型在37例自身免疫性肝炎和78例健康人之间的区别能力达到83.25％，POD指数在自身免疫性肝炎患者中明显升高，两组之间有显著性差异(p＜0.001)。

9.一种用于区别自身免疫性肝炎和健康人群的试剂盒，包括用于检测权利要求1所述的SEQ ID NO:1-5所示的5种微生物基因的引物。

10.一种用于区别自身免疫性肝炎和健康人群的肠道微生物模型，所述模型基于高通量测序数据在队列中建立，所述模型建立有自身免疫性肝炎患病率(probability ofdisease，POD)指数；POD指数可用于计算其区别能力，进行验证。