[发明专利]靶向基因组分析的方法在审
申请号: | 202010078573.1 | 申请日: | 2013-12-10 |
公开(公告)号: | CN111254500A | 公开(公告)日: | 2020-06-09 |
发明(设计)人: | 克里斯多弗·K·雷蒙德;克里斯多弗·D·阿莫尔;林继力 | 申请(专利权)人: | 分析生物科学有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12N15/10 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 美国华*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶向 基因组 分析 方法 | ||
1.产生经标记的基因组文库的方法,包括:
(a)用末端修复酶处理片段化的基因组DNA,从而产生片段化的经末端修复的基因组DNA;和
(b)将随机核酸标记序列以及任选地样本编码序列和/或PCR引物序列与所述片段化的经末端修复的基因组DNA连接,从而产生所述经标记的基因组文库。
2.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述随机核酸标记序列为约2至约100个核苷酸。
3.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述随机核酸标记序列为约2至约6个核苷酸。
4.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述片段化的经末端修复的基因组DNA包含平末端。
5.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述平末端被进一步修饰而包含单碱基对悬垂部分。
6.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述连接包括将多功能适配子组件与所述片段化的经末端修复的基因组DNA连接,从而产生所述经标记的基因组文库,其中所述多功能适配子分子包含:
(i)第一区,其包含随机核酸标记序列;
(ii)第二区,其包含样本编码序列;和
(iii)第三区,其包含PCR引物序列。
7.如前述权利要求中任一项所述的方法,还包括将经标记的基因组文库与多功能捕获探针组件杂交,从而形成复合物,其中所述多功能捕获探针组件与所述基因组文库中的特定基因组靶标区杂交。
8.如前述权利要求中任一项所述的方法,还包括分离所述经标记的基因组文库-多功能捕获探针组件复合物。
9.如前述权利要求中任一项所述的方法,还包括用3′-5′核酸外切酶酶催化处理所述分离的经标记的基因组文库-多功能捕获探针组件复合物,从而去除单链3′端。
10.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述用于3′-5′核酸外切酶酶催化处理的酶为T4 DNA聚合酶。
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