[发明专利]一种基于微型分子标记的恰特草鉴定方法及应用有效

专利信息
申请号: 202010085501.X 申请日: 2020-02-08
公开(公告)号: CN111139312B 公开(公告)日: 2021-02-02
发明(设计)人: 陈云霞;南程慧;薛晓明;谢春平;吴显坤;黄娅琳;郭海涛;蒋敬;吉小林 申请(专利权)人: 南京森林警察学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 黄欣
地址: 210023 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 微型 分子 标记 恰特草 鉴定 方法 应用
【权利要求书】:

1.一组用于鉴定恰特草分子的引物组合物,其特征在于:所述引物组合物由用于扩增恰特草微型分子标记mat K、rbc L和trn H-psb A的引物组成;

所述用于扩增mat K的引物序列如下:

CeK1-F 5' CCGCAAAGTAGAAGAAGC 3'

CeK 1-R 5' ACGGAGTCAAATGGTGGA 3'

CeK 2-F 5' TGCCAATAATCCAATCAAAG 3'

CeK 2-R 5' TGCCAATAATCCAATCAAAG 3'

CeK 3-F 5' GATTCGCTCAAGAAGGAC 3'

CeK 3-R 5' GATGCTGGGTGAAAGATG 3'

CeK 4-F 5' TTCCAAGTCCAATACTCA 3'

CeK 4-R 5' TACTCGAATGGATCAACA 3'

CeK 5-F 5' AATGACTGAGAAACCCTC 3'

CeK 5-R 5' GACTTCCTATACCCACTT 3';

所述用于扩增rbc L的引物序列如下:

CeL1- F 5' CCACAAACCGAGACTAAA 3'

CeL1-R 5' CCAAAGACATTACCCACA 3'

CeL2-F 5' GAGCCCGTTGCTGGAGAA 3'

CeL2-R 5' CGCGGAGACATTCATAAACT 3'

CeL3-F 5' CAAGTATGGACGCCCTCT 3'

CeL3-R 5' TCTCGGCAATAATGAGCC 3'

CeL4-F 5' GTACATGCGAAGAAATGA 3'

CeL4-R 5' CTTGAGTGAAATAAATACCG 3'

CeL5-F 5' GTAGTAGGTAAACTTGAGGGTG 3'

CeL5-R 5' CGAGCAAGATCACGTCCC 3';

所述用于扩增trn H-psb A的引物序列如下:

CeH-A-F 5' TGCAATCTTTCTCGTCTA 3'

CeH-A -F 5' AAAGGGAATTGGTTATCG 3'。

2.权利要求1所述的引物组合物在恰特草鉴定中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述恰特草样品的DNA发生降解。

4.一种DNA发生降解的恰特草样品种属鉴定方法,其特征在于:包括以下步骤:

步骤1,从待测样品中提取叶绿体DNA序列;

步骤2,以步骤1的叶绿体DNA序列作为模板,采用权利要求1的引物组合物对其进行PCR扩增,扩增产物进行Sanger双向测序;

步骤3,根据测序结果,对mat K基因的5个微型片段CeK1、CeK2、CeK3、CeK4、CeK5进行拼接,对rbcL基因的5个微型片段CeL1、CeL2、CeL3、CeL4、CeL5进行拼接,获得完整序列,用获得的CematK、CerbcL、CetrnH-psbA完整序列片段进行BLAST同源比对,确定样品种属。

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