[发明专利]用于癌症的个体化疫苗

权利要求书

1.用于提供个体化癌症疫苗的方法，其包括以下步骤：

(a)鉴定癌症患者肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变，以提供所述患者的癌症突变标记；以及

(b)提供以步骤(a)获得的所述癌症突变标记为特征的疫苗。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述鉴定癌症特异性体细胞突变的步骤包括鉴定一个或更多个癌症细胞的外显子组的癌症突变标记。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述鉴定癌症特异性体细胞突变的步骤包括一个或更多个癌症细胞的单细胞测序。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述癌症细胞为循环肿瘤细胞。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述鉴定癌症特异性体细胞突变的步骤涉及使用新一代测序(NGS)。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述鉴定癌症特异性体细胞突变的步骤包括对所述肿瘤样本的基因组DNA和/或RNA进行测序。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述鉴定癌症特异性体细胞突变的步骤至少以一式两份的方式重复。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其包括确定鉴定出的突变在用于癌症疫苗接种之表位中的可用性的另外步骤。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法，其中以所述患者的突变标记为特征的所述疫苗包含多肽或编码所述多肽的核酸，所述多肽包含基于突变的新表位。

10.根据权利要求9所述的方法，其中所述多肽包含多至30个基于突变的新表位。

11.根据权利要求9或10所述的方法，其中所述多肽还包含由癌症细胞表达的不含癌症特异性体细胞突变的表位。

12.根据权利要求9至11中任一项所述的方法，其中所述表位在其天然序列环境中以形成疫苗序列。

13.根据权利要求12所述的方法，其中所述疫苗序列的长度为约30个氨基酸。

14.根据权利要求9至13中任一项所述的方法，其中所述新表位、表位和/或疫苗序列头尾连接地排列。

15.根据权利要求9至14中任一项所述的方法，其中所述新表位、表位和/或疫苗序列通过接头分隔开。

16.根据权利要求1至15中任一项所述的方法，其中所述疫苗为RNA疫苗。

17.根据权利要求1至15中任一项所述的方法，其中所述疫苗为预防性和/或治疗性疫苗。

18.可通过根据权利要求1至17中任一项所述之方法获得的疫苗。

19.包含重组多肽或编码所述多肽的核酸的疫苗，所述重组多肽包含基于突变的新表位，所述新表位因癌症患者肿瘤样本中的癌症特异性体细胞突变而产生。

20.根据权利要求19所述的疫苗，其中所述多肽还包含由癌症细胞表达的不含癌症特异性体细胞突变的表位。

21.治疗癌症患者的方法，其包括以下步骤：

(a)通过根据权利要求1至17中任一项所述的方法提供个体化癌症疫苗；和

(b)向所述患者施用所述疫苗。

22.治疗癌症患者的方法，其包括向所述患者施用根据权利要求18至20中任一项所述的疫苗。