[发明专利]猪MID1基因作为死亡率相关的分子标记及其应用

说明书

本发明提出了与仔猪死亡率相关的SNP标记，所述SNP标记选自SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第145位核苷酸，为碱基C或T。利用该分子标记可准确预测不同基因型群体猪之间死亡率性状的差别，准确、高效地选育出母猪繁殖能力佳的优良猪品种，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。在猪育种工作中，该分子标记可作为死亡率性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而缩短世代间隔，提高选择强度，提高选种效率和准确性。

技术领域

本发明涉及SNP标记及其应用。具体地，本发明涉及猪MID1基因作为死亡率相关的分子标记及其应用。更具体地，本发明涉及仔猪死亡率相关的SNP标记及其应用。

背景技术

随着我国居民生活水平的提高，人们对肉类食物的需求逐渐增加。在人们对肉类需求增长的推动下，我国养殖业增长迅速。2019年10月14日发布的《中国的粮食安全》白皮书中显示2018年中国猪、牛、羊肉的人均占有量为46.8公斤，比1996年增加了16.6公斤，增长55％。在我国养殖业提供各类肉品中，猪肉是最大宗的肉类消费品，约占消费肉类的63％左右。根据2012年的年鉴数据，生猪产值占了农业总产值的18％，是我国单项产值最大的农产品，产值规模相当于水稻、小麦和玉米等主要作物的产值总和。不过，目前我国居民人均肉类消费水平仍远低于欧美发达国家，我国养猪生产效率远不能完全满足我国居民对肉类消费日益增加的需求。

繁殖性状是影响养殖效益的重要经济性状，直接制约母猪的繁殖力和养殖场的收益。对繁殖性状进行遗传改良，提高猪的繁殖性能是提高养殖效益有效途径。母猪的总产仔数、死胎数、断奶仔猪数、窝产仔猪体重及性别比例等是衡量母猪繁殖性能的重要指标，并受到诸多因素的影响。母猪第一胎的繁殖性能通常表现不佳，提高第一胎的繁殖能力可有效提高母猪的繁殖性能。母猪繁殖能力主要体现为产仔数的构成，包括总产仔数、产活子数、弱仔数、死仔数、木乃伊数等，其中由总产仔数、死仔数、木乃伊数构建的死亡率指标是度量母猪繁殖性能的常用指标之一，死亡率等于母猪第一胎次分娩当日的总死亡仔数除以总出生仔数，其中总死亡数等于死胎数加木乃伊个体数。通过育种从遗传上改良母猪的死亡率性状可从根本上提高母猪的繁殖效率。死亡率性状是低遗传力性状，常规育种手段进展缓慢，挖掘猪死亡率的分子标记，通过分子辅助选择可加快猪死亡率性状的改良进程。

然而，目前针对仔猪死亡率的SNP标记仍有待研究。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题。为此，本发明提出了与仔猪死亡率相关的SNP标记、用于检测该SNP标记的引物组和试剂盒及其应用、预测仔猪死亡率的方法和系统以及猪选育系统。由此，利用该分子标记可准确预测不同基因型群体猪之间死亡率性状的差别，准确、高效地选育出母猪繁殖能力佳的优良猪品种，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点。在猪育种工作中，该分子标记可作为死亡率性状的可靠标记，便于进行早期选择，从而缩短世代间隔，提高选择强度，提高选种效率和准确性。

其中，需要说明的是，SNP(single nucleotide polymorphism,SNP，即单核苷酸多态性)是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。

在本发明的一个方面，本发明提出了一种与仔猪死亡率相关的SNP标记。根据本发明的实施例，所述SNP标记选自SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第145位核苷酸，为碱基T或C。