[发明专利]一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒

权利要求书

1.检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法，包括以下步骤：以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增VAMP7基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型；

所述的VAMP7基因的拷贝数变异区域位于VAMP7基因参考基因组序列AC_000170.1的14678001bp- 14686000bp；

所述的引物对P1为：

上游引物F1：5’- GCTAGCGTGTACTTTTGGTGT -3’

下游引物R1：5’- ACTTAGCTAAACAGTGGCTAGG -3’；

所述的引物对P2为：

上游引物F2：5’- AACCAGGAGAAACTCGCCAA -3’

下游引物R2：5’- TTCGGTGAAATGCCCTCTCG -3’；

所述的拷贝数变异类型是根据2*2^−ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，2*2^−ΔΔCt大于2；缺失型，2*2^−ΔΔCt小于2；正常型，2*2^−ΔΔCt等于2；

具有正常型拷贝数变异类型的个体在生长性状上较优；

所述生长性状为十字部高；

所述黄牛选自云岭牛。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的扩增体系包括10ng/μL模板DNA 1 μL以及10 pM的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各0.5 μL。

3.如权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的反应程序为：95℃预变性5~10 min；95℃变性15 s，60℃退火15 s，72℃延伸30s，共39个循环。

4.如权利要求1所述的应用，其特征在于：基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为166bp，基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为166 bp。