[发明专利]甲状腺结节相关rDNA甲基化标志物及其应用

说明书

本发明涉及用于甲状腺结节良恶性早期鉴别的rDNA甲基化标志物及应用。具体地，本发明提供一种甲状腺结节良恶性早期非侵入性鉴别的rDNA甲基化标志物及应用，发明人基于测定的甲状腺癌和甲状腺良性结节患者血液样本rDNA甲基化测序数据分析，鉴定出鉴别甲状腺结节良恶性的标志物，基于本发明的标志物组群，可以有效鉴别甲状腺结节的良恶性且具有较高的灵敏度和特异性，为甲状腺结节良恶性的鉴别提供了新方法。检测过程无创，安全性高。同时因为血液样本可以常温运输，大大提高了检测的方便性。

技术领域

本发明涉及一种甲状腺结节相关rDNA甲基化标志物及其应用，用于早期鉴别甲状腺结节良恶性，属于分子生物医学技术领域。

背景技术

近年来，甲状腺结节的发病率在中国逐年增加。甲状腺结节的治疗很大程度上取决于对其良恶性的鉴别。据报道，大多数发现的甲状腺结节是良性的，恶性的占比约在5-15%。临床上目前最常用的鉴别措施是综合患者的病史、临床特征、甲状腺结节的超声检查，必要时配合进行细针穿刺活检，同时结合血清学标志物、穿刺物的基因检测等多种手段进行联合检测进行鉴别。但是，由于良性和恶性结节的细胞学特性非常相近，很多样本很难通过穿刺活检判断良恶性。另外，由于缺乏特异性的鉴别标志物，现有的基于基因突变或者基因表达检测的分子诊断方法的灵敏度及特异性均比较低，而且是创伤性的，都不可避免的有很大的局限性。因此，现有的诊断方法难以实现甲状腺结节良恶性的早期非创伤性鉴别及大规模的人群筛查，导致了大量良性结节患者接收活检这一创伤性检查，也造成了大量不必要的甲状腺切除术及过度治疗。同时，也有很多恶性结节患者漏检，造成了极大的损失。因此，本领域需要开发一种适用于临床甲状腺结节良恶性早期鉴别的非创伤性检测方法。Xianglin Zhang等发现核糖体DNA(rDNA)的基因间间隔区（IGS）中甲基化位点在多种癌症（肺癌、结直肠癌、肝癌等）血浆中均表现为低甲基化。这项研究支持rDNA甲基化标志物可能能作为癌症诊断的标志物。现有技术并未明确如何通过rDNA甲基化的情况来鉴别甲状腺结节良恶性。

发明内容

本发明的目的是：提供了一种对样品的rDNA进行甲基化检测，利用检测结果的差异甲基化分析分辨甲状腺良性结节和恶性结节，实现甲状腺结节无创精准诊断的目的。

具体地，本发明第一方面提供了一种分离的来自哺乳动物的核酸分子，所述核酸分子是与甲状腺良恶性相关的核糖体DNA甲基化标志物，所述核酸分子包括选自（1）-（15）中的一组或多组rDNA位点：（1）1112、1116、1119、1130和1141，（2）2565、2568、2571、2582、2584和2586，（3）2650、2659、2661、2670、2673、2678、2684、2688、2698和2708，（4）4491、4496、4507、4533、4535、4556、4583、4587、4597、4604和4607，（5）5773、5783、5785、5790和5798，（6）7089、7102、7115、7117、7120、7122、7124、7126、7131、7138、7145和7148，（7）8553、8565、8568、8576和8583，（8）8680、8690、8694、8698、8702、8718和8724，（9）9323、9326、9328、9332和9335，（10）9339、9352、9368、9371和9377，（11）21720、21727、21740和21757，（12）36572、36596、36604、36620、36622和36630，（13）36985、36988和36996，（14）38500、38502、38554、38571、38588、38596和38602，（15）38957、38974、38980、38982、39004和39012，所述rDNA位点的碱基编号对应于参考基因组Genebank号U13369.1。