[发明专利]一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统在审
申请号: | 202010140224.8 | 申请日: | 2020-03-03 |
公开(公告)号: | CN111341442A | 公开(公告)日: | 2020-06-26 |
发明(设计)人: | 韩方剑;余莉;黄少冰;姜培 | 申请(专利权)人: | 宁波兰茜生物科技有限公司 |
主分类号: | G16H50/20 | 分类号: | G16H50/20;G16H30/40;G06T7/00;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 宫建华 |
地址: | 315200 浙江省宁波市镇*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多功能 一体化 肺癌 辅助 诊断 系统 | ||
1.一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统,其特征在于,包括:
硬件平台,其包括有处理器Ⅰ、处理器Ⅱ、图形处理器单元Ⅰ、图形处理器单元Ⅱ和ARMCortex-A57;
CNN算法框架,其由多个网络层组成,所述网络层用于将输入数据转换为输出,同时学习越来越高级的功能;
所述处理器Ⅰ、处理器Ⅱ、图形处理器单元Ⅰ和图形处理器单元Ⅱ在计算机上进行,而经由CNN算法框架训练之后的模型算法部署在ARM Cortex-A57上用于实际扫描推断;
训练集,其来自HE染色肺部组织切片,所述HE染色肺部组织切片由扫描仪转换成全数字切片,并借助远程病理诊断辅助系统由专业的病理专家进行精确标注;
测试集,其数据不需要将所有HE染色肺部组织切片的切块混合在一块,将每张HE染色肺部组织切片的所有切块一起馈送至模型中测试结果是否与预期的一致。
2.根据权利要求1所述的一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统,其特征在于:所述处理器Ⅰ和处理器Ⅱ的型号相同,且均为16核3.2GHz,所述图形处理器单元Ⅰ和图形处理器单元Ⅱ的型号相同,均为RTX2080Ti。
3.根据权利要求1所述的一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统,其特征在于:所述CNN算法框架为卷积神经网络架构,所述HE染色肺部组织切片分别来自长沙湘雅医院、长沙市第一医院等大型三甲医院。
4.根据权利要求1所述的一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统,其特征在于:所述扫描仪除了能自动扫描病理切片并将其转换成全切片数字图像之外,还能在转换过程中将全切片数字图像切成小图块,这些小图块适用于卷积神经网络无需借助openslide工具进行切图,大大节省了数据集处理加工的时间。
5.根据权利要求1所述的一种多功能一体化肺癌辅助诊断系统,其特征在于:所述扫描仪扫描完一张HE染色肺部组织切片后将其自动切成256x256的小图块供模型训练,这样能节省大量图像处理的时间,在训练集和验证集的所有切块中,需去掉仅含背景区域的空白切块;
将训练集中所有切片的切块图像打乱,根据每个切块是否包含病灶区域来标定是否为有癌,只要有一个区域包含病灶区域即标记为1,如果没有任何病灶区域则标记为0。
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