[发明专利]小麦籽粒锌含量QTL qZn-3B的分子标记

说明书

本申请属于小麦分子育种技术领域，具体涉及小麦籽粒中锌元素含量相关QTL qZnC.hnaas‑3B紧密连锁的分子标记SNP2471及其应用的专利申请。SNP2471标记位于小麦3B染色体上，其第36位碱基为一个36A‑36G的多态性位点，具有A/G多态性，当该位点为AA时，小麦籽粒中锌元素含量较高，当该位点为GG时，小麦籽粒中锌元素含量较低。本申请中，发明人利用高密度SNP芯片基因型鉴定结果，结合鉴定数量性状中常用的关联分析方法，对小麦籽粒中锌元素积累表型与基因型之间的关联性进行了分析，最终筛选、鉴定获得了与小麦籽粒锌元素积累紧密连锁的位点与基因，而基于此可开发相应的功能标记，从而可为富锌小麦新品种培育奠定一定技术基础。

技术领域

本申请属于小麦分子育种技术领域，具体涉及小麦籽粒中锌元素含量相关QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用的专利申请。

背景技术

小麦（Triticum aestivum L.）是世界上最重要的谷类作物之一，其产品提供人类饮食中20%的能量和蛋白质。但是营养统计表明，全世界约有20亿人口无法从日常饮食中摄取到足够的矿质元素，导致存在着较为普遍的营养不良现象。其中，锌元素的摄入不足即是较为典型的矿质元素摄入不足的代表。研究表明，人体内锌元素摄入不足时可对人类健康带来严重影响，典型如：可造成婴幼儿发育障碍、智力低下及适龄女性生育能力降低等问题。也因此，培育富含营养元素小麦新品种是缓解矿质元素摄入不足问题的一种重要技术途径。

现有研究表明，小麦籽粒中锌元素含量是一种复杂的数量性状，受多基因控制。因此，为培育富含锌元素的小麦新品种，如果利用传统育种手段对富锌小麦种质资源进行筛选，势必存在选择效率低、周期长、稳定性差等缺陷。分子标记辅助育种是解决该技术难题的有效手段。但需要注意的是，利用分子标记育种技术来提高小麦籽粒锌元素含量的前提是获得与小麦籽粒中锌元素积累有利的实用型分子标记。为此，开展小麦籽粒中锌元素积累的QTL定位及分子标记开发研究，对提升小麦营养健康品质和加速富锌小麦新品种选育工作具有积极的作用。

发明内容

本申请的主要目的在于提供两个与小麦籽粒中锌元素含量相关QTL紧密连锁的SNP分子标记qZnC.hnaas-3B（SNP2471）和qZnC.hnaas-5A（SNP1014），为富锌小麦品种的培育奠定一定技术基础。

本申请所采取的技术方案详述如下。

与小麦籽粒中锌元素含量性状QTL qZnC.hnaas-3B（简写为：QTL qZn-3B）紧密连锁的SNP分子标记SNP2471，位于小麦3B染色体上，以“中国春”参考基因组v1.1版本参考序列为准，具体在第376,625,452位核苷酸处，其具体核苷酸序列为：

AGGTTTCCATATTATACACTGGTGCTTCCAAATCT[A/G]ATTTTTTTGGTTCAATGAAATAATAACTGCTTCAT，

其中第36位碱基（即“[A/G]”表示形式）为一个36A-36G的多态性位点，具有A/G多态性；具体而言：

当该位点为AA时，小麦籽粒中锌元素含量相对较高，为富锌有利基因型（也即，可以认为是高锌含量小麦）；核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示（72bp），具体为：

AGGTTTCCATATTATACACTGGTGCTTCCAAATCTAAATTTTTTTGGTTCAATGAAATAATAACTGCTTCAT；

当该位点为GG时，小麦籽粒中锌元素含量较低；为富锌不利基因型（也即，可以认为是低锌含量小麦）；核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示（72bp），具体为：

AGGTTTCCATATTATACACTGGTGCTTCCAAATCTGGATTTTTTTGGTTCAATGAAATAATAACTGCTTCAT。