[发明专利]一种用于鉴定猪背膘厚度的SNP标记及其应用方法在审
申请号: | 202010153558.9 | 申请日: | 2020-03-06 |
公开(公告)号: | CN113355430A | 公开(公告)日: | 2021-09-07 |
发明(设计)人: | 唐中林;袁鹏翔;易国强;杨亚岚 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京康思博达知识产权代理事务所(普通合伙) 11426 | 代理人: | 刘冬梅;范国锋 |
地址: | 518000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 猪背膘 厚度 snp 标记 及其 应用 方法 | ||
1.一种用于鉴定猪背膘厚的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上,在AMOTL1基因内部。
2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处,存在T/C多态性。
3.根据权利要求2所述的SNP标记,其特征在于,所述位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处的SNP位点的基因型为TT的猪,相较于基因型为TC和CC的猪,具有较低的背膘厚度。
4.根据权利要求3所述的SNP标记,其特征在于,用于检测所述SNP位点基因型的方法中涉及PCR扩增反应和单碱基延伸反应,
所述PCR扩增反应的扩增引物为P1和P2,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3所示;
所述单碱基延伸引物为P3、P4和P5,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。
5.一种鉴定或辅助鉴定猪背膘厚的方法,其特征在于,所述方法包括确定待测猪个体位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处SNP标记的基因型的步骤。
6.一种筛选低背膘厚的猪群体的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
步骤i,提取待测猪的基因组DNA;
步骤ii,以基因组DNA为模板,进行PCR扩增;
步骤iii,确定待测猪SNP标记的基因型;
步骤iv,根据基因型筛选猪群体。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤ii中,所述PCR扩增产物包括位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处的SNP标记。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤iv中,若待测猪个体上述SNP位点处的基因型为TT,则具有较低的背膘厚,可以选择;若待测猪上述SNP位点处的基因型为TC或CC,则具有较高的背膘厚,应该淘汰。
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