[发明专利]一种用于鉴定猪背膘厚度的SNP标记及其应用方法在审

专利信息
申请号: 202010153558.9 申请日: 2020-03-06
公开(公告)号: CN113355430A 公开(公告)日: 2021-09-07
发明(设计)人: 唐中林;袁鹏翔;易国强;杨亚岚 申请(专利权)人: 中国农业科学院农业基因组研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 北京康思博达知识产权代理事务所(普通合伙) 11426 代理人: 刘冬梅;范国锋
地址: 518000 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 鉴定 猪背膘 厚度 snp 标记 及其 应用 方法
【权利要求书】:

1.一种用于鉴定猪背膘厚的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上,在AMOTL1基因内部。

2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处,存在T/C多态性。

3.根据权利要求2所述的SNP标记,其特征在于,所述位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处的SNP位点的基因型为TT的猪,相较于基因型为TC和CC的猪,具有较低的背膘厚度。

4.根据权利要求3所述的SNP标记,其特征在于,用于检测所述SNP位点基因型的方法中涉及PCR扩增反应和单碱基延伸反应,

所述PCR扩增反应的扩增引物为P1和P2,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3所示;

所述单碱基延伸引物为P3、P4和P5,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。

5.一种鉴定或辅助鉴定猪背膘厚的方法,其特征在于,所述方法包括确定待测猪个体位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处SNP标记的基因型的步骤。

6.一种筛选低背膘厚的猪群体的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

步骤i,提取待测猪的基因组DNA;

步骤ii,以基因组DNA为模板,进行PCR扩增;

步骤iii,确定待测猪SNP标记的基因型;

步骤iv,根据基因型筛选猪群体。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤ii中,所述PCR扩增产物包括位于国际猪基因组10.2版本参考序列9号染色体上第30,730,577个核苷酸处的SNP标记。

8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤iv中,若待测猪个体上述SNP位点处的基因型为TT,则具有较低的背膘厚,可以选择;若待测猪上述SNP位点处的基因型为TC或CC,则具有较高的背膘厚,应该淘汰。

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