[发明专利]一种快速检测新型冠状病毒的CRISPR-Cas13方法在审
申请号: | 202010154654.5 | 申请日: | 2020-03-08 |
公开(公告)号: | CN111235313A | 公开(公告)日: | 2020-06-05 |
发明(设计)人: | 李超;高恶斌;汪智婷;严园园;雷朋;姚颜萍;尹昌胜;李珮铷 | 申请(专利权)人: | 深圳市创新医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12R1/93 |
代理公司: | 南京中律知识产权代理事务所(普通合伙) 32341 | 代理人: | 祝坤 |
地址: | 518000 广东省深圳市福田区华强*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 新型 冠状病毒 crispr cas13 方法 | ||
1.一种用于快速检测新型冠状病毒的检测试剂盒,其特征在于:包括250nM LwaCas13a蛋白、200nM EiCsm6蛋白、20uM Csm6活化剂、2.5uM LwaCas13a-crRNA、RNase抑制剂、反应缓冲液、20uM RNA报告基团LF-Reporter;所述反应缓冲液为40mM Tris-HCl、60mM NaCl、6mM MgCl2的混合液,pH为7.3;其中,LwaCas13a蛋白、EiCsm6蛋白、Csm6活化剂、LwaCas13a-crRNA、RNase抑制剂、反应缓冲液、LF-Reporter的体积比为3~5:0.5~1.5:0.5~1.5:0.5~1.5:0.5~1.5:10~14:1~2混合而成。
2.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:该试剂盒使用时,将检测试剂盒中的各组分在0℃温度下混合,添加待检测液并充分混合后,在35.8-38.5℃℃水浴锅中孵育30-40分钟,再添加无RNA酶的DEPC水溶液,采用一次性核酸检测试纸条检测阴性或阳性。
3.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒用于检测的新型冠状病毒RNA的浓度不小于10fM,其Orf1ab RNA基因序列如SEQ ID NO.1所示。
4.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:当检测试剂盒为20微升体系时,试剂盒中包括250nM LwaCas13a蛋白4微升、200nM EiCsm6蛋白1微升、20uM Csm6活化剂0.5微升、2.5uM LwaCas13a-crRNA 0.5微升、RNase抑制剂1微升、反应缓冲液(40mM Tris-HCl、60mM NaCl、6mM MgCl2、pH7.3)11微升、20uM LF-Reporter1微升,剩余为待检测液。
5.一种快速检测新型冠状病毒的CRISPR方法,其特征在于:
(1)配制待检测液的稀释液
将待检测液与无RNA酶的DEPC混合进行稀释,配制一定体积及溶度的稀释液备用;
(2)配制检测试剂
先配制40mM Tris-HCl、60mM NaCl、6mM MgCl2的反应缓冲液,其中pH为7.3,再按照体积比3~5:0.5~1.5:0.5~1.5:0.5~1.5:0.5~1.5:10~14:1~2依次将250nM LwaCas13a蛋白、200nM EiCsm6蛋白、20uM Csm6活化剂、2.5uM LwaCas13a-crRNA、RNase抑制剂、反应缓冲液、20uM LF-Reporter准备各组分,将步骤(1)中待检测液添加;
(3)孵育处理
混合液配制过程一直在0℃温度进行操作,充分混合后,将检测试剂盒内混合液在预热的35.8-38.5℃水浴锅中孵育30-40分钟;
(4)检测及结果
将步骤(3)中试剂放入反应管中,检测试纸条要求检测混合液不低于50微升,不足50微升添加适应的无RNA酶的DEPC水补足,混合,将其置于室温管架中,将一次性核酸检测试纸条放入每个反应管中,然后等待反应液流过试纸条,阳性对照样品应仅显示蓝色检测线,而阴性对照样品显示红色和蓝色两条检测线。
6.根据权利要求5所述的一种快速检测新型冠状病毒的CRISPR方法,其特征在于:其中,该方法用于检测浓度不小于10fM的新型冠状病毒RNA,其Orf1ab RNA基因序列如SEQ IDNO.1所示。
7.Csm6活化剂在包含权利要求1-4任一所述用于快速检测新型冠状病毒的检测试剂盒中的应用,其基因序列如SEQ ID NO.4所示。
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