[发明专利]一种基于大数据的白血病基因融合筛选系统及方法

说明书

本发明属于基因工程技术领域，公开了一种基于大数据的白血病基因融合筛选系统及方法，基于大数据的白血病基因融合筛选系统包括：基因融合模块、文件维护模块、实验管理模块、主控模块、数据提取模块、数据分析模块、图像分析模块、筛选模块、可视化操作模块、报告生成模块、数据管理模块、显示模块；基于大数据的白血病基因融合筛选方法包括进行基因数据的融合；确定基因的筛选标准；对基因数据、图像进行分析；对分析后的基因信息进行筛选；生成基因筛选报告，对基因筛选报告进行存储和管理。本发明通过对基因的融合实现对全部基因的收集，方便筛选；对基因的图像信息和数据信息进行分别分析，能够实现分析、筛选准确性的提高。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域，尤其涉及一种基于大数据的白血病基因融合筛选系统及方法。

背景技术

目前，慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia，CLL)是一类在生物学行为和临床进程上存在很大异质性的恶性B淋巴细胞性白血病。多种分子指标，如免疫球蛋白重链可变区域突变状态、细胞遗传学异常、ZAP-70和CD38的表达与其预后直接相关。MYD88在固有免疫中起到关键作用并影响B细胞的新陈代谢。MYD88基因的突变，以位于TIR域的L265P突变最为常见。含有这种MYD88突变的慢性淋巴细胞白血病患者有比较明显的NF-KB信号通路基因的表达，他们的临床表现也出现得更早。另外，MYD88基因的突变往往与药物的抵抗和慢淋患者的预后有一定的相关性。因此，检测CLL患者MYD88p.L265P基因突变对指导临床判断预后和指导用药尤为重要。随着技术的发展，基因突变检测的方法也日新月异，但是针对白血病的基因融合筛选系统缺少准确可靠的检测体系，检测效率低。

通过上述分析，现有技术存在的问题及缺陷为：现有的针对白血病的基因融合筛选系统缺少准确可靠的检测体系，检测效率低。

发明内容

针对现有技术存在的问题，本发明提供了一种基于大数据的白血病基因融合筛选系统及方法。

本发明是这样实现的，一种基于大数据的白血病基因融合筛选方法包括以下步骤：

第一步，通过基因融合程序进行基因数据的融合，所述融合方法包括：

选定数据库；所述数据库包括预先存储本地的基因数据库和云服务器共享的公共基因数据库；

将选定数据库内的基因数据和基因图像导入融合数据库；

对融合数据库内的基因信息进行融合；

第二步，所述第一步进行基因数据的融合后，通过文件维护程序对单个基因形成的文件进行维护；所述维护方法包括：

对原始文件中的各个重点位置进行注释分析；

对数据库文件的浏览与常规操作进行管理；

对整个数据库文件的搜索与过滤以及基础数据的保存；

第三步，通过实验管理程序对实验进行设计，确定基因的筛选标准；通过数据提取程序进行融合后的基因信息的提取；所述提取方法包括：读取融合数据库中的基因信息，包括图像信息和数据信息；

对所述基因的筛选标准进行分类，确定提取类别；

提取融合数据库中的全部基因的图像信息，并对全部基因进行提取类别对应信息的提取；

第四步，通过数据分析程序对第三步提取的基因数据进行分析，接收提取的基因信息的数据源，所述基因信息为结构化信息；

第五步，结合基因的筛选标准从多个所述数据源中训练生成用于分析数据源的基因标准库；

第六步，使用基因标准库从每个数据源中提取至少两个具有逻辑关系的维度及对应的维度值；