[发明专利]基于环介导恒温扩增和微流控芯片生殖道支原体检测方法在审
申请号: | 202010164224.1 | 申请日: | 2020-03-11 |
公开(公告)号: | CN111304346A | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 张薇 | 申请(专利权)人: | 重庆市第四人民医院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12R1/35 |
代理公司: | 重庆晶智汇知识产权代理事务所(普通合伙) 50229 | 代理人: | 施永卿 |
地址: | 重庆市渝中*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 环介导 恒温 扩增 微流控 芯片 生殖 支原体 检测 方法 | ||
1.基于环介导恒温扩增和微流控芯片生殖道支原体检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)引物设计;从公共数据库中获得Uu、Up、Mh、Mg四种支原体的功能基因序列,用Muscle进行多序列比对,结合工具得到consensus序列;以consensus序列为输入,结合工具剪切得到满足要求的引物序列;以剪切得到的引物序列做blast比对,结合工具得到初步的引物筛选结果,利用公共数据库进行进一步的引物筛选和特异性检测,得到最后的引物集;
(2)微流控芯片制作;所述微流控芯片为碟式芯片,所述芯片固定有步骤(1)所述的生殖道支原体引物;
(3)恒温扩增反应体系配制;将恒温扩增试剂于室温解冻、融化,摇匀并离心;在体系区,吸取9.0μL恒温扩增试剂加入200μL离心管中,并移至PCR模板加样区;在PCR模板加样区,加入9.0μL被检样品或者对照品的DNA,摇匀并离心;
(4)芯片加样;在模板区,从试剂盒中取出芯片使其恢复至室温,用移液器吸取18.0μL步骤(3)配制好的核酸扩增反应体系,从进出样口加入到芯片主通道中,待其充满芯片主通道即停止加样,并用封口膜封住进出样口,将加样后的芯片固定在低速离心机上,以6000rpm离心30秒后取下;
(5)核酸扩增和结果判读;将碟式芯片放入核酸分析仪中进行扩增,温度63℃,时间50分钟,检测完成后软件将自动对荧光数据进行处理和分析。
2.根据权利要求1所述的基于环介导恒温扩增和微流控芯片生殖道支原体检测方法,其特征在于,所述解脲脲原体(Uu)引物核酸序列如SEQ ID NO.1-6所示,所述微小脲原体(Up)引物核酸序列如SEQ ID NO.7-12所示,所述人型支原体(Mh)引物核酸序列如SEQ IDNO.13-18所示,所述生殖支原体(Mg)引物核酸序列如SEQ ID NO.19-24所示。
3.根据权利要求1所述的基于环介导恒温扩增和微流控芯片生殖道支原体检测方法,其特征在于,所述引物满足条件如下:1)35%GC含量65%;2)引物不会形成发卡结构,反向互补序列不能长于5mer;3)引物序列不能有超过5个连续单碱基重复;4)引物之间不会形成二聚体。
4.根据权利要求1所述的基于环介导恒温扩增和微流控芯片生殖道支原体检测方法,其特征在于,所述微流控芯片共24个检测反应池,一张芯片可同时检测3个样品 。
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