[发明专利]抗原结合能力根据化合物的浓度而变化的抗原结合分子及其文库

权利要求书

1.一种文库，主要包含：

(i)序列彼此不同的多个抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子；或

(ii)编码该序列彼此不同的多个抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子的核酸；

该文库的特征在于，所述抗原结合结构域或抗原结合分子是抗原结合活性根据低分子化合物的浓度而变化的抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子。

2.权利要求1所述的文库，其是由包括下述步骤(a)和(b)的方法制造的：

步骤(a)鉴定抗原结合活性根据低分子化合物的浓度而变化的抗原结合结构域或具有低分子化合物结合活性的抗原结合结构域中满足以下(i)至(iii)中任一者以上的氨基酸位点；

(i)未参与结合该低分子化合物的1个或多个氨基酸位点，

(ii)在亲本抗原结合结构域所属的动物种的抗体谱中具有氨基酸出现频率的多样性的1个或多个氨基酸位点，

(iii)对于经典结构的形成不重要的1个或多个氨基酸位点；和

步骤(b)设计文库，该文库包含：在所述抗原结合结构域中，编码未改变体的核酸以及分别编码在步骤(a)中鉴定的1个或多个氨基酸位点具有改变的、序列彼此不同的所述抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子的多个改变体的核酸。

3.权利要求2所述的文库，其是由包括下述步骤(a)至(d)的方法制造的：

步骤(a)鉴定抗原结合活性根据低分子化合物的浓度而变化的抗原结合结构域或具有低分子化合物结合活性的抗原结合结构域中满足以下(i)至(iii)中任一者以上的氨基酸位点；

(i)未参与结合该低分子化合物的1个或多个氨基酸位点，

(ii)在亲本抗原结合结构域所属的动物种的抗体谱中具有氨基酸出现频率的多样性的1个或多个氨基酸位点，

(iii)对于经典结构的形成不重要的1个或多个氨基酸位点；

步骤(b)制作在步骤(a)中鉴定的1个或多个氨基酸位点具有改变的、序列彼此不同的所述抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子的多个改变体；

步骤(c)鉴定实质上不对所述各改变体的该低分子化合物结合活性造成变化的1个或多个氨基酸的改变；和

步骤(d)制造文库，该文库包含：编码未改变体的核酸以及编码在步骤(c)中鉴定的1个或多个氨基酸具有改变的、序列彼此不同的所述抗原结合结构域或包含抗原结合结构域的抗原结合分子的多个改变体的核酸。

4.权利要求1所述的文库，其是由包括下述步骤1)和2)的方法制造的：

步骤1)使包含多个抗原结合分子的文库与低分子化合物接触，所述抗原结合分子具有低分子化合物结合活性；和

步骤2)由该文库浓缩核酸，所述核酸编码具有低分子化合物结合活性的抗原结合分子的多个改变体。

5.权利要求4所述的文库，其中，所述抗原结合分子是包含抗体的重链可变区和轻链可变区的抗原结合分子，且是通过包括下述步骤1)至3)的任1步骤的方法制造的：

步骤1)从权利要求4所述的文库浓缩编码具有低分子化合物结合活性的抗原结合分子的多个改变体的核酸来设计文库，其中权利要求4所述的文库是包含编码位于重链可变区的氨基酸经改变的1个或多个改变体的核酸的文库；

步骤2)从权利要求4所述的文库浓缩编码具有低分子化合物结合活性的抗原结合分子的多个改变体的核酸来设计文库，其中权利要求4所述的文库是包含编码位于轻链可变区的氨基酸经改变的1个或多个改变体的核酸的文库；

步骤3)组合由步骤1)和步骤2)的各可变区文库浓缩得到的编码抗原结合分子的核酸，由此设计文库。

6.权利要求1至5中任一项所述的文库，其特征在于，所述抗原结合分子是抗原结合结构域与病毒外壳蛋白的至少一部分的融合多肽。

7.权利要求1至5中任一项所述的文库，其中，所述抗原结合分子是包含抗体的重链和轻链的抗原结合分子，且该文库进一步包括设计所述重链和/或轻链的合成文库的步骤。