[发明专利]一种谷子大斑病早期诊断的方法有效
申请号: | 202010171644.2 | 申请日: | 2020-03-12 |
公开(公告)号: | CN111334601B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 李志勇;白辉;王永芳;申浩冉;董志平;马继芳;全建章;刘磊 | 申请(专利权)人: | 河北省农林科学院谷子研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 李兴林 |
地址: | 050035 河北*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 谷子 大斑病 早期 诊断 方法 | ||
1.一种谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取样本DNA;
(2)以步骤(1)中提取的DNA为模板,SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示的核苷酸序列为引物组进行PCR;
(3)对PCR扩增产物进行检测;
所述SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示的核苷酸序列如下:
SEQ ID No.4:5’-TCTCTTGGTTCTGGCATCGA-3’;
SEQ ID No.5:5’-CCCAGCAAGAGGGAGACAA-3’。
2.根据权利要求1所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(2)中采用25.0μL的PCR反应体系,其中2×Es Taq Master Mix 12.5μL,引物浓度都为10μM,加入量各1.0μL,模板DNA 1.0μL,ddH2O 9.5μL。
3.根据权利要求2所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(2)中PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃30s,55℃30s,72℃1min,35个循环;72℃延伸10min。
4.根据权利要求1-3任一项所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR能扩增出194bp的特异性条带则说明样本已被谷子大斑病菌侵染。
5.根据权利要求1所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(2)中进行实时荧光定量PCR。
6.根据权利要求5所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(2)中实时荧光定量PCR的反应体系为20μL:10μL2×SYBR Premix,0.4μL ROX Reference Dye,引物各0.8μL,2μL DNA模板,6μL不含核酸酶的水。
7.根据权利要求6所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(2)中实时荧光定量PCR的反应条件为:50℃2min,95℃10min,95℃15s,60℃1min,运行40个循环;然后95℃15s,60℃1min,再从60℃每秒上升0.3℃至95℃15s,收集荧光,用于绘制熔解曲线。
8.根据权利要求7所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,所述步骤(3)中以不同浓度的阳性质粒DNA样品为模板进行荧光定量PCR,绘制出反应的标准曲线,根据检测样品循环阈值对其模板含量进行定量分析。
9.根据权利要求8所述的谷子大斑病早期诊断的方法,其特征在于,绘制的标准曲线为Y=-3.523X+27.818,R2=0.999。
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