[发明专利]一种鉴定三疣梭子蟹遗传性别的方法在审
申请号: | 202010177021.6 | 申请日: | 2020-03-13 |
公开(公告)号: | CN111218516A | 公开(公告)日: | 2020-06-02 |
发明(设计)人: | 陆俊锴;李荣华;张周毅;张伟佳;王春琳;母昌考;宋微微 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6879;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 315200 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 梭子蟹 遗传性 别的 方法 | ||
本发明提供一种鉴定三疣梭子蟹遗传性别的方法,其中使用了用于鉴别三疣梭子蟹性别的SNP位点,所述的SNP位点位于序列为SEQ ID NO:1片段;或由SEQ ID NO:1取代、缺失、添加一个或几个核苷酸,由SEQ ID NO:1衍生片段的第1452位,为1452AG。本发明所提供的SNP位点分子标记在雄性个体中呈现二等位基因杂合型,而在雌性个体中均呈现等位基因纯合型,可以采用PCR扩增测序方法或KASP方法进行检测。检测方法灵活,结果稳定,其中KASP检测方法通量较高,检测速度快,应用简单,为三疣梭子蟹全雌苗种的繁育提供重要工具。
技术领域
本发明属于水产生物遗传育种技术领域,具体涉及一种鉴定三疣梭子蟹遗传性别的方法。
背景技术
三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)广泛分布于中国、朝鲜、日本等海域,是一种重要的大型海产经济蟹类。中国自20世纪90年代开始三疣梭子蟹的人工养殖,由于其口感好、营养丰富,深受大众喜爱,而且雌性红膏蟹市场价格远高于雄蟹。因此,进行三疣梭子蟹全雌单性养殖,具有良好的市场前景。性别连锁分子标记的开发有利于快速鉴定性反转个体,加快全雌三疣梭子蟹育种进程。
分子标记技术是一个用来鉴定遗传性别的有效工具。单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,SNP)作为第三代分子标记在基因分型中得到了广泛的应用。竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP),是基于等位基因特异性寡核苷酸延伸和荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)信号的单个SNP基因分型方法之一,已成为一项全球性的基准技术,具有高通量、低成本、高灵敏度和特异性等特点。
发明内容
本发明提供一种鉴定三疣梭子蟹遗传性别的方法,其中使用了用于鉴别三疣梭子蟹性别的分子标记,可快速进行高通量的性别鉴定,从而弥补现有技术的不足。
本发明首先提供一种三疣梭子蟹性别鉴定标记的SNP位点(PtS1),所述的SNP位点位于序列为SEQ ID NO:1片段;或由SEQ ID NO:1取代、缺失、添加一个或几个核苷酸,由SEQID NO:1衍生片段的第1452位,为1452AG。
本发明还提供用于三疣梭子蟹性别鉴定的分子试剂,所述的试剂用于检测上述的SNP位点;
所述的分子试剂,其一种是用于PCR扩增测序方法的试剂;另一种是用于KASP检测方法的试剂;
其中用于PCR扩增测序方法的试剂,包含有用于检测上述SNP位点的PCR扩增测序的引物对,其序列信息如下:
PS7 Forward:5'-TTAAGTTTGAGTATTGAGTATCCAC-3'(SEQ ID NO:2)、
PS7 Reverse:5'-AATGAGAAGTATTGTAAATGATGTT-3'(SEQ ID NO:3);
其中用于KASP检测方法的试剂,其中包含有如下的引物:
PtS1FAM(SEQ ID NO:4):
GAAGGTGACCAAGTTCATGCTATTTTTGTACACTACACCTCCCCC、PtS1HEX(SEQ ID NO:5):
GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTTTGTACACTACACCTCCCCT、PtS1C(SEQ ID NO:6):GCTAGAAAGGGRTGTAGCAAACAAGTT;
本发明再一个方面提供检测三疣梭子蟹的雌雄性别的方法,是通过检测上述的SNP位点来辨别三疣梭子蟹的雌雄性别;
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