[发明专利]一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台在审
申请号: | 202010186816.3 | 申请日: | 2020-03-17 |
公开(公告)号: | CN111307982A | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 刘双江;刘畅;周楠;姜成英 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N27/62;G01N21/31 |
代理公司: | 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 | 代理人: | 高琦 |
地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 药物 候选 肠道 作用 效果 体外 通量 筛选 平台 | ||
1.一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,包括以下步骤:
A.根据药物候选物及目标人群的肠道菌群特征选择多个代表性的肠道菌种模拟简化的人体肠道微生物环境;
B对所述肠道菌种在微生物培养基中稀释后置于集成孔板中,所述肠道菌种的菌悬液的初始浓度应保持在吸光度值为0.2-1.0之间;
C.通过微流控高通量分液系统将目标药物候选物分别滴加在所述集成孔板后对所述肠道菌种在连续供气装置中进行厌氧培养;
D.培养12-72小时对所述肠道菌种进行基于生长参数的表型检测和代谢产物检测;
E.根据对所述肠道菌种生长表型检测和目标化合物的微生物代谢产物检测,对药物候选物与肠道微生物相互作用效果实现高通量筛选。
2.根据权利要求1所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,所述代谢产物检测通过集成孔板中所述肠道菌种生物量变化反映不同所述药物候选物对所述肠道菌种代谢产物检测活性的影响。
3.根据权利要求1所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,所述代谢产物检测采用的方法可以是色谱法、质谱法或者色谱-质谱联用的方法。
4.根据权利要求1所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,所述生长参数包括但不限于可见光范围内的吸光度值和荧光吸光度值。
5.根据权利要求1所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,所述肠道菌种的选择方法包括,根据待筛选药物候选物确定本次筛选所针对的目标人群,再根据目标人群菌群特征的分析结果,提取其中各个菌种的相对丰度,出现频率,显著差异程度等特征信息,并以这些信息为标准确定选择特定的代表性肠道菌种数量和种类,以构建承载所述肠道菌种的集成多孔板。
6.根据权利要求1所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,所述生长表型检测通过计算添加了药物候选物的多个所述肠道菌种处理组与其对应的空白对照组的吸光度值比值,判断所述药物候选物是否对肠道菌种的生长表型的造成影响。
7.根据权利要求6所述的一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台,其特征在于,当所述吸光度值的比值1.0时,判定菌种可以代谢和利用该化合物,当比值=1.0判定菌种不可以代谢和利用该化合物。
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