[发明专利]水稻抗稻瘟病基因Pi68(t)紧密连锁分子标记及其应用有效
申请号: | 202010194074.9 | 申请日: | 2020-03-19 |
公开(公告)号: | CN111254212B | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
发明(设计)人: | 杨勤忠;董丽英;刘树芳;徐鹏;陶大云;汤翠凤;周家武;李静;李迅东;岳元保;周伍民 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院农业环境资源研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 云南凌云律师事务所 53207 | 代理人: | 康珉 |
地址: | 650205 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 稻瘟病 基因 pi68 紧密 连锁 分子 标记 及其 应用 | ||
1.水稻抗稻瘟病基因Pi68(t)紧密连锁分子标记STS68-7,其特征在于,所述紧密连锁分子标记STS68-7为用STS68-7F引物和STS68-7R引物PCR扩增非洲栽培稻渗入系IL106的片段,目标片段长度131bp,所述STS68-7F引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,STS68-7R引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
2.权利要求1所述的水稻抗稻瘟病基因Pi68(t)紧密连锁分子标记STS68-7在水稻抗稻瘟病分子标记辅助育种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,用STS68-7F引物和STS68-7R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中扩增出的片段长度为131bp,则目标水稻材料含有抗稻瘟病基因Pi68(t)位点。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,用STS68-7F引物和STS68-7R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中扩增出的片段长度为136bp,则目标水稻材料不含抗稻瘟病基因Pi68(t)位点;或用STS68-7F引物和STS68-7R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中同时扩增出131bp和136bp两个片段,则目标水稻材料为含有抗稻瘟病基因Pi68(t)位点的杂合水稻材料。
5.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系20μL,其中含有2×ES Taq Master Mix 10μL、10μM STS68-7F引物1μL、10μM STS68-7R引物1μL、10ng/μL模板DNA 1μL,ddH2O 7μL;PCR扩增的反应条件为:95℃预变性3min;95℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;最终72℃延伸5min。
6.水稻抗稻瘟病基因Pi68(t)紧密连锁分子标记STS68-15;其特征在于,所述紧密连锁分子标记STS68-15为用STS68-15F引物和STS68-15R引物PCR扩增非洲栽培稻渗入系IL106的片段,目标片段长度165bp,所述STS68-15F引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,STS68-15R引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
7.权利要求6所述的水稻抗稻瘟病基因Pi68(t)紧密连锁分子标记STS68-15在水稻抗稻瘟病分子标记辅助育种中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,用STS68-15F引物和STS68-15R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中扩增出的片段长度为165bp,则目标水稻材料含有抗稻瘟病基因Pi68(t)位点。
9.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,用STS68-15F引物和STS68-15R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中扩增出的片段长度为184bp,则目标水稻材料不含抗稻瘟病基因Pi68(t)位点;或用STS68-15F引物和STS68-15R引物通过PCR扩增在目标水稻材料中同时扩增出165bp和184bp两个片段,则目标水稻材料为含有抗稻瘟病基因Pi68(t)位点的杂合水稻材料。
10.根据权利要求8或9所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系20μL,其中含有2×ES Taq Master Mix 10μL、10μM STS68-15F引物1μL、10μM STS68-15R引物1μL、10ng/μL模板DNA 1μL,ddH2O 7μL;PCR扩增的反应条件为:95℃预变性3min;95℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;最终72℃延伸5min。
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