[发明专利]一种基于荧光视频的神经元胞体自动识别系统有效
申请号: | 202010194079.1 | 申请日: | 2020-03-19 |
公开(公告)号: | CN111368793B | 公开(公告)日: | 2023-10-27 |
发明(设计)人: | 吴钧杰;王汉斌 | 申请(专利权)人: | 南京景瑞康分子医药科技有限公司 |
主分类号: | G06V20/69 | 分类号: | G06V20/69;G06V20/40;G06V10/26;G06T7/136;G06T7/155 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区创*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 荧光 视频 神经元 自动识别 系统 | ||
1.一种基于荧光视频的神经元胞体自动识别系统,其特征在于该系统由构造视频模块Z1、胞体识别分割模块Z2和用户偏好设置模块Z3组成,其中:
构造视频模块Z1将输入的荧光视频V0[X,Y,T0]重构为构造视频V[X,Y,T],并输出到胞体识别分割模块Z2,其中X、Y、T0分别为荧光视频V0[X,Y,T0]的宽度、高度和视频时长,X、Y、T分别为构造视频V[X,Y,T]的宽度、高度和视频时长;
胞体识别分割模块Z2从构造视频V[X,Y,T]中识别分割得到疑似神经元胞体区域集合M{mi[X,Y],i=1,...,n},并将M输出到用户偏好设置模块Z3,其中mi[X,Y]为第i个疑似神经元胞体区域,X和Y分别为每一个疑似神经元胞体区域的宽度和高度,n为疑似神经元胞体区域集合中的识别结果数量;
用户偏好设置模块Z3根据用户设定的灵敏度权重w1、特异度权重w2和可信度权重w3,将疑似神经元胞体区域集合M{mi[X,Y],i=1,...,n}按照加权判定方法输出神经元胞体识别结果集合其中为第j个神经元胞体识别结果,X和Y分别为每一个神经元胞体识别结果的图像宽度和高度,n*为神经元胞体识别结果集合中识别结果的数量。
2.如权利要求1所述的一种基于荧光视频的神经元胞体自动识别系统,其特征在于构造视频模块Z1由视频随机打乱模块Z11、信号非线性归一化放大器Z12和特征整合模块Z13组成,其中:
视频随机打乱模块Z11将荧光视频V0[X,Y,T0]在时间方向上随机打乱K次,生成随机打乱的荧光视频并输出到信号非线性归一化放大器Z12;
信号非线性归一化放大器Z12根据自适应的滑窗长度w和步长s,将V0[X,Y,T0]划分成视频序列V0,P{V0,p[X,Y,w],p=1,...,T},其中V0,p为视频序列V0,P的第p个视频、T=(T0-w)/s+1,随后将每一个视频V0,p转化为信号非线性归一化放大视频得到非线性归一化放大视频序列并输出到传递到特征整合模块Z13,同时Z12根据自适应的滑窗长度w和步长s,将划分成视频序列Vr,P{Vr,p[X,Y,w],p=1,...,T},并将每一个视频Vr,p转化为信号非线性归一化放大视频得到非线性归一化放大视频序列并输出到特征整合模块Z13;
特征整合模块Z13将视频序列中每一个视频通过降维计算得到一张特征图,依次得到特征图序列特征整合模块Z13同时将视频序列中每一个视频通过降维计算得到一张特征图,进而依次得到特征图序列特征整合模块Z13对特征图序列的每一帧进行特征加权整合,最后得到一个构造视频V[X,Y,T]并输出到胞体识别分割模块Z2。
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